为了能够让布鲁斯恢复原样、科学省和IPC研发的疫苗晶片和异次元转换器一起派上用场、由热斗和洛克人亲自上场对付变成黑暗机器生命体的布鲁斯、炎山又在最紧要的关头上阵、总算将被封印住的布鲁斯找了回来…
阴影人在佛鲁迪的帮助下再度复活, 誓言要找利卡尔博士抱仇、但是这场邪恶对邪恶的决战、阴影人根本就不是利卡尔博士的对手、三两下就被删除了…
卡尔博士为了达成藉住黑暗机器生命体以统治整个地球的目的, 甚至不惜和雷射人进行融合, 与洛克人等网路领航员作战, 热斗和洛克人差点不敌, 但在所有网路领航员好友的帮助下, 终于证实了邪不胜正的道理, 保住了人类世界的和平…