信长打败今川义元的桶狭间之战已过去四年。在京都，三好长庆掌权，将军足利义辉完全成了傀儡。义辉已失去干劲儿像变了一个人似的。在藤孝等人企划下，光秀被叫到京都，陪义辉谈话。为了让将军恢复权力，光秀约定会说服如今势头正健的信长上洛。另一方面，驹和东庵围绕新药的研制发生争吵，从诊所冲了出去。在和伊吕波太夫造访大和时，驹遇到了正在布施穷人的僧侣觉庆。她很关心这个僧人。

光秀带着将军义辉的信前往信长处。但是，信长正陷于攻打美浓的苦战中，说话的空儿都没有。光秀转而拜托藤吉郎，却听他说，京都流传说三好长庆的儿子们计划刺杀义辉。光秀得知在背后穿针引线的人是松永久秀后，备受打击。很快，他去大和拜访松永，询问松永的真实意图。松永表示：“义辉没有当将军的器量，如此下去世道无法太平，我们不准备杀他，而是打算流放他。”

三好、松永的儿子们发动政变，将军义辉被害。围绕突然空缺的将军宝座，京都分裂成义辉之弟觉庆的拥立派与义荣的拥立派。三好要取觉庆的性合，松永、藤孝帮助觉应从大和脱身，并把他藏了起来。另一方面，光秀听闻义辉的死讯，前往松永处，激烈地谴责暗杀义辉的行径。松永把朝仓义景写来的信拿给光秀看。信上说，如果觉庆有将军之器量，那朝仓家就做好准备藏匿他，为了向光秀确认这一点，所以才写了信。光秀对此并不感兴趣，松永则问他是否真的愿意像这样置身事外，在越前压抑地活下去。