一路跋山涉水过后，众人总算来到云南地界，也趁此之际，孟无染作为一家之主，率先代表孟家发表感慨，同时拿出一份名册，逐一进行点名，其中包括李冬来李冬来，而他流浪多年，终于有了归宿。
孟海棠独自来到山上栽种树苗，幸得她精心呵护，才能继续得以生长。恰巧身后传来脚步声，孟海棠急忙回头望去，隐约看到穿着空军军装的人影，起初误以为是张启，定睛一看才发现是曾念乔。
在面对孟海棠的追问，曾念乔没有透露张启的下落，只是代为转交张启开之前写好的书信，亦是一封遗书。当孟海棠坐上火车的那一刻，忍不住泪流满面，而在信的内容里，全都是表达着张启对于赴死报国的决心。
尽管没有等来梦想的和平，但是张启相信迟早有一天会打赢这场仗，也幸好自己能在活着的时候，保护百姓们安然无恙，只希望带着战火、灾难，以及一切的黑暗而去，只留下最美好的送给孟海棠。
当天夜里，孟海棠坐在窗前给张启回信，永不忘记他在海棠树下笑容，也庆幸遇到对方，从此爱上天空和飞行。随后的日子里，复华大学等多所学校落户云南，大批南迁的学者在这短暂的历史中，放射出耀眼的光芒，他们踏实做事，低头做人，潜心学问，静心育生，在此期间所产生的的各种思想文化，也可以算作是文化精神上的抗战。
张启和曾念乔为丁母寻得一处院落，可让她在这边安心居住，同时认拜对方为义母，代替丁焕生为其养老送终。凌问岳夫妇在收拾文物时，品鉴了猿人头骨化石，怎知当地村民看到后，不由大惊失色，显然是将他们当作吃人的怪物。
村里的小孩岩泰失踪，大家怀疑起复华大学的老师，集结众人前去算账。凌问岳拦住情绪激动的村民，为他们耐心解答头骨化石的出处，几个特务趁机溜进学校里，康揽杉和孟海棠立马用木箱堵住房门。
张启得知复华大学出事，匆忙赶了过去，看到特务用石头砸窗，于是开枪喝令他们停手。孟海棠疑似听到张启的声音，可又不敢开门瞧个究竟，反倒是枪声吸引了白督办的民兵团，此时张启早已离去。
许媛茵带着李冬来沿迹寻来，看到面色苍白的张启，并且发现他似乎不想让孟海棠知道自己还活着的消息。而在另一边，岩泰因为溜进学校偷吃，以至于睡过头没有回家，如今水落石出，白督办斥责大家对老师的无理，同时告诫他们以后不许闹事。
考虑到学校之后的安全问题，孟无染希望白督办派兵剿匪，顺便让人手保护学校，以免附近山匪过来闹事，毕竟里面保存许多珍贵文物以及古籍善本。白督办故作为难，表示此需从长计议，还得先写信向蒋介石汇报，一层一层复核，等到批准方可。
孟无染看出白督办是故意找借口，实则想要在复华大学开办师资班，于是当场答应了下来，也允许他将自己的儿子送来学校。与此同时，陆子仪让徐特联系白督办的手下，咬死是村民闹事，以免查到自己头上。
李冬来搀扶张启回到住处，意外与母亲重逢相认。到了第二天早上，丁母为张启下厨煲汤，引起李冬来的不满，认为她对张启胜过亲生儿子。但是丁母知道张启与丁焕生是过命交情，况且这段时间对自己多有照顾。至于孟海棠通过许媛茵得知张启还活着，急忙下床去找她，怎知还没出门，曾念乔已将她拦下。
李冬兰并不待见张启，也不认同他这位义兄，反倒得知孟海棠日思夜想的恋人正是对方。曾念乔从外面进来，期间透露自己已经见过孟海棠，阻止她来找张启。而李冬来为孟海棠抱打不平，意外了解到大哥的死与张启有关，于是追问前因后果。
张启没有闪烁其词，如实承认自己将丁焕山丢给日本人，果然此话一出，李冬来怒不可遏，丁母急忙上前劝阻。考虑到丁母在旁边，张启提议去外面单独交谈，曾念乔实在是不放心，所以跟着来到树林里。为了平息李冬来的愤怒，张启拿出一枚纪念币，决定效仿丁焕山的方式，倘若出现“航空救国”的字样，便由李冬来结束自己的生命。
而接下来的结果毫无悬念，李冬来一怒之下拔枪对准张启，奈何迟迟下不去手。反观张启正大光明地直面枪口，讲述了丁焕山牺牲的过程，临死之前只有一个要求，就是希望李冬来以后能成为像丁焕生这样的男人，行得正坐得端，无愧于天和地。
最终李冬来抬手朝空中开枪，痛恨自己无能，在他发泄过后，平息了内心的仇恨，与张启冰释前嫌。孟海棠暂时无法与张启见面，唯有将怀念寄托于风铃，可父亲居然考虑要给她安排亲事，孟海棠为此果断反对，独自来到山上对着树苗倾诉心事。张启跟着曾念乔回部队，途径山下看到孟海棠，不由深受触动，急急忙忙跑了过去，听见孟海棠祈祷自己平安的话语。
久别重逢后的二人，格外珍惜当下，张启也不再有任何隐瞒，款款深情地表达着对于孟海棠的爱意。当初在他见到孟海棠第一面，便已爱上对方，只不过碍于面子，所以谎称是飞行员意外拍下的照片都放在飞机里，事实上是他个人的私心。陆子仪派人扮作黄包车夫，直接将萧鸿恩拉到郊外。
徐特作为陆子仪的传声筒，命令萧鸿恩从此之后负责监视凌问岳的一举一动，并且要极力阻止他编写考古论文。本来萧鸿恩没有答应，甚至认为考古论文利于国家丰富历史文化，没有任何坏处，可陆子仪出面回答了萧鸿恩的疑惑。
因为在日本人看来，凌问岳的论文是否定日本文化关键之证，随时都会激怒日军政府，使得中日关系越发紧张，战争冲突明显。陆子仪早已查到萧鸿恩曾在日本留学，甚至加入日本军国特务组织盘龙社。其实萧鸿恩早年根本不知道盘龙社的性质，以为是纯粹的革命组织，可即便如此，还是难以为其洗白，一旦曝光就极有可能背负汉奸的名声。
萧鸿恩不希望龙珍珠知道这件事情，被迫同意为陆子仪卖命，帮助他寻找武丁甲。这天张启等人重聚，结伴去山里散心，曾破山趁着大家都在，于是当众向许媛茵求婚，令在场所有人羡慕不已。如今曾破山已升为机长，至于张启还在养伤阶段，旁人都不知具体情况，唯有孟海棠通过曾念乔知道张启体内的子弹。
孟海棠也宣布自己继续深造学业，决定要用毕生精力推动以及普及女性学识教育，这一想法得到大家的支持，张启更是为之骄傲。在这乱世之下，能够再次相聚已是不易，大家站在镜头前，合影一张。待所有人结伴返回时，发现黎教官已在复华大学门口等候多时，原来是想邀请曾念乔一同去看电影。
凌浅樱看到这一幕，心里醋意翻腾，而其他人也都觉得气氛尴尬微妙，曾念乔找了个借口先离开。孟海棠带着张启回家，同时将风铃下的从军姓名牌交给他，表示自己之前在杭州湾捡到，现在也算是物归原主。
张启并没有收下，而是让孟海棠继续留着，承诺之后会继续给她做风铃。此时凌浅樱过来通知张启，代替父亲邀请他过门一聚，张启告别孟海棠之后，便独自来到凌家，主动向凌问岳询问武丁甲的下落，从而得知武丁甲丢失之事。
通过凌问岳的讲述，张启知道陆子仪在暗中追查武丁甲下落，如今陆子仪正为日本人做事，所以张启和曾念乔决定要率先一步寻回武丁甲。正当张启和曾念乔交谈此事，忽然察觉到有人藏在树后，怎知对方竟是李冬来，一脸自豪地表示自己做了件大事，紧接将武丁甲交到张启手里。
幸好武丁甲失而复得，张启批评李冬来以后不许再有行窃之事，但是考虑到金至烈藏起武丁甲，故意给所有人设下一个大局，意味着武丁甲的重要性，所以决定先由他来保管，暂且不还给凌问岳。
龙珍珠来到昆明，第一时间去见了萧鸿恩，透露自己将要上大学读书。萧鸿恩笑着应和，并未完全放在心里，殊不知她真实身份乃是白督办的亲生女儿，本名叫做白珍珠，这次也是按照党组织命令，表面是进入复华大学，实则暗中保护凌问岳。
孟海棠陪着曾破山选购结婚的布料，未曾察觉楼上有何异样，反倒是龙珍珠站在二楼窗户，等着店老板忙完才与其交接情报。曾穆长途跋涉总算是来到昆明，奈何他衣衫破烂，像极了乞丐，惨遭当地小伙子欺负。
曾穆眼看着随身携带瓦罐都被小伙子抢走，这一路在后面追赶，碰巧遇到许媛茵和凌浅樱，便向二人求助，再三强调绝不可打开瓦罐。尽管凌浅樱初到云南没多久，却很清楚当地的民风，于是计上心来，故意透露里面有令人丧命的蛊毒，果然大家听到后转身就跑。
虽已拿回了瓦罐，曾穆依旧是心有余悸，从未想过云南民风犹如强盗，光天化日之下抢东西。待曾穆安顿好住处，与张启等人讨论飞机改造，提升其性能，而张启也从中得到了启发，最终决定西山号成为曾破山的座机，叮嘱他铭记无论战况如何，该返航时必须返航。
举办婚礼的前夕，曾破山亲自为许媛茵做好秋千，和她憧憬着未来，许媛茵也希望此刻不变，亲朋好友能永远在一起。曾家父子们围桌把酒言欢，过往恩怨消失殆尽，曾穆催促大儿子曾念乔尽快操心自己的婚姻大事。
奈何曾念乔在感情方面太过木讷，根本不懂得主动，反倒是他在弟弟和父亲的提醒下，才意识到黎教官对自己有意。而在另一边，凌浅樱和孟海棠为许媛茵布置婚房，谈话间提及孟海棠应该尽快跟张启考虑婚事，不过孟海棠觉得只要彼此心里有对方，无所谓何时结婚，况且她还要在学业上深造。
看着孟海棠一脸幸福的模样，两人忍不住八卦她和张启之间的感情，追问她是从何时喜欢上对方。孟海棠仔细回想，觉得应该是在日军轰炸医院当天，她第一时间想到张启的安危，于是跑到海棠树边祈祷张启能够平安归来，没想到居然应验，内心说不出的喜悦。凌浅樱依稀记得之前曾有大师算出孟海棠的未来丈夫身上有海棠花，这让孟海棠笃定自己与张启是命中注定。