身为拥有多年历史的日暮神社家的女儿~日暮篱，在15 岁当天意外地被妖怪拉进「食骨之井」，穿越了时空进入古代的战国时代。在那里她与宿命的冤家，一个由妖怪与人类结合所生的半妖少年---犬夜叉相遇，并无意间解开了犬夜叉身上的封印使其复活。
拥有无限妖力的「四魂之玉」原本藏在日暮篱的体内，在一次与妖怪的争夺战里，「四魂之玉」破碎开来分散于各地，阿篱与犬夜叉两人因而踏上搜集碎片之旅，并在冒险的旅程中，陆续发生了许多事……。
虽然枫姥姥告诉阿篱和犬夜叉两人必须同心协力，才能找回散落各处的四魂之玉碎片，但是不合的两人，加上一心想回到现代，寻找散落的四魂之玉，更加困难。偏偏这时候出现了一个操纵头发的妖魔，她把阿篱推进了食骨之井……。