徐长明从李行义那里得知李时珍已经死了，斯语等人悲痛万分。大家正在给李时珍办丧事的时候，李时珍却奇迹般地回来了。原来，李时珍掉下山崖之后，幸亏被八戒师父发现。李时珍与斯语相见，相拥而泣。李时珍来到大牢之中看望李行义。李行义已经被判处凌迟处死，于是他提出让李时珍帮忙，让他体面地死去。李时珍设法给他一杯药酒，等到行刑时，李行义已安乐死去。

嘉靖病愈后看见发疯的景王，便交待崔方，让他离开人间少受些罪。然后召见李时珍，想让他为自己寻找长寿之法，但李时珍却向皇上提出自己已经决意要离开太医院，回家乡去安心修本草。嘉靖无柰，同意让李时珍离去。李时珍离京之前，将一本医药笔记交给徒弟金基泰，让他带回朝鲜，将中华医药学发扬光大。

李时珍回蕲州后，费尽周折将苌葶接回，与家人团聚，然后带着儿子建元和徒弟庞宪等人专心编修《本草》，他们还辗转湖广、江苏等地，历尽千辛万苦，寻医问药，为修本草收集第一手资料。万历六年，六十一岁的李时珍终于完成《本草》编修，并取名《本草纲目》。

为了此书付印，李时珍带着黄一丰东奔西走却到处碰壁，顾先生出面请王世贞为此书写序。万历十八年，金陵藏书家胡承龙见到《本草纲目》，并欣然应允出资刻印此书。此后不久，李时珍和斯语先后去世。

三年后，《本草纲目》全部刻印完毕，苌葶满意地离去。李时珍儿子建元将这部巨著进献给神宗皇帝，神宗派使者将《本草纲目》送往大明邻国，并流传至世界各地。《本草纲目》不仅对中医药学具有极大贡献，而且对世界自然科学的发展也起了巨大的推动作用。