李时珍的痛苦和茫然使斯语感觉到自己成了李时珍感情上最为沉重的负担，于是决定远嫁他乡。就在斯语含泪嫁人时，李时珍幡然醒悟，追回了斯语，两人终于结为夫妻。

嘉靖康复后决定搬去西苑万寿宫，朝中大小事务由严嵩代为料理。离开皇宫前他特意召见了杨雪英，并且将她留在身边加以宠幸。李行义在冰冷的宫中刚刚萌生起来的爱情，又被嘉靖占有，新仇旧恨使李行义怒火中烧。

太子在册封大典时因服用丹药而亡。李行义按舅舅老焦的苦肉计供出道长和老焦，道长和老焦被处死，李行义赢得嘉靖信任，被提升为道长。杨雪英为嘉靖怀上龙种，被皇上册封为敬妃。不料遭情同姐妹的张惠妃暗害，杨雪英流产，从此被嘉靖冷落。

又是十几年过去了，已经三十多岁的李时珍告别父母妻儿，来到楚王府担任奉祠正一职，因为治好了楚王儿子的怪病，得到楚王的赏识。

李时珍为了完成修本草大业，请求楚王推荐自己进太医院。楚王答应了，推荐李时珍进京报考太医院，并告诉他考太医院要过严世蕃这一关。

李时珍来到京城，在高拱府上找到了父亲的旧友太医院院使徐长明，并与徐长明一道为高拱诊断出多年的顽疾，深得高拱赏识。李时珍在高拱的引见下拜会了裕王，裕王乐意推荐李时珍进太医院。李时珍的推荐信经杨洪勤之手送到严世蕃手上，严世蕃气急败坏，暗示杨洪勤在考场上好好“对待”李时珍。

太医院考场上，李时珍大明医圣李时珍分集剧情介绍 第一个交卷，杨洪勤正欲做手脚，恰好徐长走进考场，表示要与杨洪勤共同监考。前面各科考试李时珍考试成绩均在大明医圣李时珍分集剧情介绍 第一，但最后一轮辨药考试中，因为杨洪勤偷梁换柱，使得李时珍中计失误。李时珍的名字被严世蕃从考生中划掉。后来，因为裕王和高拱出面力保李时珍，严嵩为了平衡各方势力，命杨洪勤将李时珍录取为太医院实习医师。李时珍终于如愿进了太医院。

接着，被录用的实习医师们在杨洪勤的带领下熟悉每一项宫廷礼仪和太医院的规矩。在实习过程中，李时珍虚心求教，隐忍苦学。