赤日神君与凤凰大战，陈炎亲手用赤霄剑刺入司马忘月心房，导致其元神消散。协助凤凰的魔族大尊身受重伤，临终前将法力传给奄奄一息的慕南，委命他接任大尊之职，当矢志保护凤凰，尽快寻得元神碎片花戎，辅佐凤凰振兴魔族。
慕南暗自发誓复活姐姐，讨伐陈炎，终在昔日的魏苍军大营废墟里发现花戎。反观陈炎拼尽全力熄灭散落在人间的凤凰之火，紧接下一秒就口吐鲜血昏倒。待陈炎醒来后，发现胸前伤口始终无法痊愈，索性继续埋头专心雕刻木像。
天帝和天后赶来拿出一颗丹药作为奖励赠予陈炎，但是天后知道这颗丹药的真正作用，实在不理解夫君为何要在暗地里惩罚。天帝表示自己这么做是为帮助儿子，抹除他在人间的一切记忆，从此再也不受爱恨情仇的困扰，没有爱就不会有恨，才会做一个真正无欲则刚的赤日神君，这也是他身为天神的代价。
果然陈炎在服完丹药后觉得有些奇怪，习惯性地拿起木像，却又不知要刻些什么东西。自此之后数千年，陈炎彻底忘记司马忘月，直到当他以炎越身份来到白鹭书院，重逢转世投胎魏枝的凤凰。
魏枝在“三生石”前看到前尘往事，深刻意识到自己经历这么多，可她没有与花戎融合，缺失之前的记忆，对于司马忘月的遭遇感到心疼，却没办法承认自己就是司马忘月。慕南对姐姐这种回应感到气愤又无力，毕竟炎越对她的威胁还未解除，天界迟早还会发现凤凰的存在，既然有第一次和第二次的斩杀，必定还会有无数次。
慕南想要做的事情是要违抗天界，以绝后患，然而魏枝决定前往天界，亲自找炎越问清楚。此刻牵机落再次发作，毒液已经蔓延心脏，命在须臾，慕南为让姐姐彻底死心，命令幽行陪同姐姐去一趟天界，唯有这种办法才能保全凤凰性命。
天帝尚且不知凤凰还存在三界，特召集炎越和意儿，准备举办他们的婚事。炎越表面顺从天帝的安排，同意与意儿成亲，实则悄悄安排意儿逃去魔族。意儿没能说服天后收回大婚命令，无奈来到魔界向慕南诉苦，希望他能明白自己的心意。奈何慕南故作冷漠，把意儿的事情当做一件无关小事，意儿有些心灰意冷，在慕南的暗示下，主动去找狼族王子求庇护。
人间将要面临一场大战，国师与魏凌月集结大军，浩浩荡荡出发前往孤城平叛。期间魏凌月的术法高深莫测，愈发精进，而她笃信凤凰就算再如何厉害，一次血脉激发照样无法施展全力，眼下就是她复仇的最好时机。
白鹭书院众师生听闻顾城遇难，毅然决然要帮助明朗，敬修甚是感动，带领全体弟子赶往顾城。明朗见到大家很是激动，又不想让他们陷入危难之中，敬修等人表示顾城乃是大虞国一份子，他们愿与明朗共进退。
魏枝在幽行的陪同下来到天界，发现周围布满符文难以进入，偏偏魔界没有符文之道，根本无法破除大阵。也正因如此，魏枝现学现画尝试破阵，恰巧遇到雨神炎洛。因为炎洛看出魏枝很有天赋，亲自教她符文。
意儿为逃婚躲到妖族境内寻找欧亚，正巧撞见蓝苏和欧亚闹别扭，询问缘由才知道是欧阳嫌弃蓝苏的饭菜难吃。尽管意儿品尝后也觉得有点过咸，但她通过菜品点破蓝苏对欧亚浓烈的情感，欧亚深受感动，当场与蓝苏和好如初。
二人听明白意儿的来意，让她放心待在妖族不必顾虑天界察觉，随后带着她去了一趟聚宝楼。夷历对意儿一见钟情，全程殷切且积极地陪在身边，意儿注意到炎越留在聚宝阁的药玉，逐渐理解他对魏枝是情深义重。
短短数个时辰，魏枝已修得普通符文师数十年的潜心修炼，炎洛愈发觉得她资质甚好，生出爱才惜才之心。然而魏枝此行并非是为学习天界术法，所以委婉辞别炎洛，独自前往炎越住处与他见面。
炎越冷漠相对，要让魏枝忘却前尘往事，不必执着于男女之情。可魏枝不甘心，直至听闻炎越将要与意儿大婚，一时激动导致牵机落发作昏迷。随后炎越把魏枝抱回房间，私下里与慕南见了面，为保魏枝平安，制造出自己与意儿成亲的幻想。
果然魏枝信以为真，彻底死心断情，待牵机落消散，便跟着慕南离开天界。这段恩怨暂且尘埃落定，唯有慕南知晓其中内情，当初炎越不忍斩杀魏枝，决定让慕南带着魏枝隐居魔界，从此退出三界纷争，而自己则是带回花戎向天帝复命，强掩心痛诀别挚爱。
正因意儿擅作主张逃婚，惹得天帝大怒，下令取消双方婚事，全力找回意儿当众责罚。此刻蓝苏带着意儿游逛桃源村，意儿看到炎越亲手雕刻的木像，通过木像感知到炎越对魏枝的情意。虽然蓝苏没有看出木像有何区别，但她道出妖族与天界截然相反的爱情观，令意儿心生羡慕和向往。
尚且被蒙在鼓里的魏枝回到魔界后，决定接受魔族圣女之位，放下杂念苦修术法，进境一日千里。由于魏凌月乃是孔雀化身，法力非同小可，普通凡人自然无法与之抗衡，顾城危在旦夕。
随着两军大战一触即发，战事传至魔界，魏枝挂念亲朋好友的安危，毅然决然要只身前往解围。慕南看着魏枝对战略兵法讲得头头是道，仿佛看到曾经的司马忘月，为此感到非常高兴，答应不让魔界护法随同。
也因魏枝的回归，让众人看到胜利的希望，明朗更是震惊不已。当晚魏枝迫不及待去探望母亲和弟弟，顾氏心中挂念女儿已久，对她又爱又恨，爱是因舐犊情深，恨是因她明知顾城凶险还要跑来涉险，魏枝闻言搂住顾氏，母女抱头痛哭。
第二天早上，魏枝与母亲、弟弟、敬修和明朗齐聚，共同商讨应对之策。如今魏枝通晓兵法令明朗觉得疑惑惊讶，同样也很高兴，魏枝感受着平凡人间给予自己的温暖，誓要扭转眼前局面，她认为与其守城不如主动出击，结果话音刚落，已经传来国师等人开始攻城。
大军兵临城下，国师口出狂言，要求明朗立刻打开城门投降，或许还能保住一命。敬修怒骂国师先后坑杀顾家老小和明成武，又戕害魏城诸多人士，所作所为罪恶滔天，国师完全不以为然。正当魏凌月还想怂恿明朗交出顾家人，岂料魏枝突然从天而降。
魏凌月率领大军兵临城下，魏枝从天而降与之交手，体内灵力忽然不受控制，继而被魏凌月偷袭坠落。也正因如此，魏凌月得意洋洋，下令全力攻打顾城，魏静月看到明朗分了神，最终死在士兵剑下，临终之际回想彼此曾经的美好时光。
待魏枝醒来无法施展灵力，自责没能帮助大家对抗敌军。顾氏没有半点责怪女儿的意思，在她看来魏枝已经尽力，眼下顾城快要守不住，便劝说魏枝尽快离开这里，自己要与顾城共存亡。
正说话间，魏凌月冲进顾家老宅，直接出手击倒顾氏母子。显然魏凌月并不打算放过魏枝，岂料顾氏率先一步挡在女儿面前，为其扛下所有伤害。魏枝看着母亲倒在怀里，无力回天，终是悲痛大恸，体内灵力紊乱，瞬间化为怒火，彻底激发凤凰血脉，导致三界动荡。
紧接下一秒，一只黑色凤凰腾空而起，众仙见状大呼不妙，唯恐灾祸将至。然魏枝爆发出强大的恐怖力量，令魏凌月难以抗衡，周围蔓延凤凰之火，连同国师等众人被火焰吞噬，化为灰烬。
天帝察觉到异样，明白炎越设局欺骗自己，直接把他叫到面前愤怒责问，对他感到非常失望，炎越闻言缄默，双手呈上佩剑交予天帝，愿领下责罚。最终天帝剥夺炎越身份，命令天兵将其带去天雷台处以九十九道天雷之刑。
正因炎越与凤凰羁绊颇深，天帝也知道留给自己的时间不多了，所以想要解决其根本还需亲自出手，与此同时，慕南来顾城找姐姐，为她检查伤势，发现她竟怀有身孕，由于孩子同时拥有天界与凤凰的血脉，需要吸取母亲的灵力而活，也会给魏枝带来极大伤害。
随着魏枝心中恶念膨胀，入魔征兆已显，院长敬修匆忙赶来查看情况，第一时间想到寻求木老的帮助。反观炎洛不忍百姓受苦，降雨浇灭凤凰之火，慕南警告他降雨可以，若是想要伤害魏枝就要做好承受后果的准备。
木老直言凤凰不会死，却会真正堕落成魔物，怒火化作凤炎焚烧天地，毁灭三界，恰恰是敬修不愿看到的局面。而眼下唯一解决之法就是敬修本身，因为他是善意的化形，只要将自己重新化作一团善念的精魄，再投入到凤凰的神魂里，自然就能平息魏枝的恶念。
除此之外，木老希望敬修能留下一点善念精魄给自己，敬修闻言很是高兴，就算付出生命的代价，只要能够挽回两个人的善念就觉得值得。而在另一边，意儿和蓝苏等人想要取得药玉为魏枝疗伤，不得已向妖王求助，妖王只好出卖色相给臭鼬大仙。
去见魏枝之前，敬修召集学院众弟子，告诫他们要心存浩然正气，永不忘白鹭书院。敬修在木老和慕南的注视下，化为善意精魄融入魏枝体内，明朗带着师兄弟们站在门外，齐齐跪地念着白鹭书院的门规，送老院长最后一程。
看着敬修消散化为虚无，就算是慕南都忍不住红了眼眶，心中动容。所幸老院长没有白白牺牲，魏枝心绪终于平复，慕南带她重回魔族休养，连续一整个月来，每天都给她灌注灵力。魏枝心知肚明，劝说慕南应该拥有自己的生活，三生石上旧精魂，意味着前尘往事已成为过去，即便魏枝与司马忘月同为凤凰，终究不是一个人，慕南没必要为她付出太多。