鹿兆鹏让白灵先跟鹿兆海转移，他为根据地取完消炎药，随后就去和白灵汇合，白灵让鹿兆鹏给他们即将出世的孩子取个名字，鹿兆鹏称不管是男孩还是女孩，都叫天明。
一早，鹿兆海找到鹿兆鹏藏身的房子，他才知道自己的嫂子竟然是白灵，鹿兆海看着身怀六甲的白灵，吃惊地不知如何是好，他转身就要离开，鹿兆鹏赶忙追上来解释，鹿兆海回身狠狠揍了他一拳，鹿兆鹏站在原地，让他尽情打自己出气。
白灵赶忙过来解释，她是真的爱鹿兆鹏，鹿兆海委屈地质问鹿兆鹏，他明明知道自己喜欢白灵，而且还一直在等着她，怎么就能忍心拆散他们，并且大声指责鹿兆鹏就带白灵过这种短暂而未知的生活，根本不是真的爱她。鹿兆鹏羞愧难当，只能连连道歉，并且表明他和白灵是经历了生死，绝望与关卡，互相扶持走到现在，他们俩的感情是认真的。鹿兆海气得火冒三丈，他声明从今天起再没有哥哥了，鹿兆海刚要离开，鹿兆鹏跪下恳求他，救出白灵和孩子，鹿兆海内心挣扎了片刻，只好答应鹿兆鹏的请求。
由于叛徒一连几天带着特务抓捕共产党，给地下组织造成很大伤害，鹿兆鹏接到任务除掉叛徒，可是叛徒非常狡猾，临时改到东门出城。鹿兆鹏蹲守在东门的时候，看到鹿兆海和白灵乘坐黄包车就从他身边走过，白灵依依不舍地望着鹿兆鹏。
鹿兆鹏看到汽车被劫停，他举枪击毙了叛徒，他也不幸中枪，白灵听到枪声，想返回去找鹿兆鹏，鹿兆海紧紧抱住她，提醒她要为孩子着想。眼看守军就要关闭城门，鹿兆海强行拉着白灵离开。
守城门的士兵拦住鹿兆海，他一气之下气得打了士兵一大耳光，他们才顺利出了城门，白灵一直不放心地回头张望，直到城门被紧紧关闭。
白嘉轩和族里的老人正在商量村里修水渠的事，他提议每家每天都要出劳力，鹿子霖急匆匆来到祠堂，埋怨白嘉轩不叫他，白嘉轩气得要赶他走，不许他参加族里的会议，鹿子霖指责白嘉轩是公报私仇，白嘉轩让他当众说明自己报的什么私仇，鹿子霖无言以对，悻悻地离开。
鹿兆海赶着马车护送白灵路过白鹿原，白灵真想回去看看白嘉轩，可是她不能回去连累家人，鹿兆海得知是白灵拿砖头砸的陶部长，对她佩服有加，觉得自己冒险护送她也值了，鹿兆鹏觉得白灵怀孕不能饿着，就提议去她姑姑家吃点饭。
姑姑看到白灵欣喜若狂，她想把白嘉轩叫来，让他们父女见一面，白灵赶忙阻止了姑姑，朱先生让她带着儿子朱怀仁给白灵做点热饭。朱先生看着白灵，心中不免感慨当年的小女孩现在也要当孩子妈妈了，朱先生得知鹿兆鹏在城里和叛徒开战，可能九死一生，就问起孩子的名字，白灵很心痛地说叫天明。朱先生赞叹白灵砸的不光是一个陶部长，还有投降派和软骨头，又亲手写了 “白鹿精魂” 这幅字送给白灵，盛赞她就是白鹿原的白鹿。
此时，田福贤带白嘉轩和鹿子霖来到白鹿书院，白灵和鹿兆海赶忙躲进屋子里。鹿子霖和白嘉轩争执不下，只好来找朱先生评理。白灵隔着窗户看到自己年迈的父亲，激动地眼泪不停地流。鹿子霖坚持要留下来吃饭，并走进屋子，他突然看到鹿兆海和白灵，吓得赶紧出来。鹿子霖要拉田福贤和白嘉轩离开，白嘉轩还想找朱先生给他们评理，鹿子霖表示不用朱先生劝解了，他承认是自己错了，并不停地和白嘉轩赔礼，急忙拉他们俩回去喝酒。白灵看着父亲离开，心中百感交集，鹿兆海想拉白灵的手，可还是忍住了。随后，白灵和鹿兆海离开了白鹿书院。
鹿子霖请田福贤和白嘉轩喝酒，他连连赔不是，白嘉轩却一言不发，田福贤声明，岳维山让他天天盯着鹿子霖和白嘉轩，如果不能活捉鹿兆鹏和白灵，自己就得被砍头。等田福贤走了以后，鹿子霖一把拉住白嘉轩要今天的饭钱，因为都是为了保护他闺女白灵不被田福贤发现，白嘉轩才知道停在白鹿书院的马车是鹿兆海送白灵的，白嘉轩埋怨他不早点说，然后急急忙忙赶往村外。
鹿兆海依依不舍地和白灵告别，她想知道鹿兆海还恨不恨鹿兆鹏，鹿兆海声明，自己恨他，这一点永远无法改变，鹿兆海只想知道还能不能见到白灵，她表示三五年内恐怕不行。临走前，鹿兆海紧紧搂着白灵，心中愁肠百转，鹿兆海自己知道，这世上再没有人能让他动心了，他永生不娶。
白嘉轩远远地看到白灵又被人接走了，直到看不见女儿的身影。白灵被安全转移到龙湾村一个大娘家里，大娘一家人已经成功安置了二十三个女同志，大娘的儿子是地下党，儿媳种地做饭，他们俩还有一个儿子叫狗子。
白孝文因为白灵的事被停职审查，他向白嘉轩不停地发牢骚，指责都是鹿兆鹏把白灵带坏的，并且试探着问白嘉轩知不知道白灵还怀了鹿兆鹏的孩子，他想从白嘉轩口中套出白灵的下落，白嘉轩早看出他回来的目的就是盯人。
白灵以为鹿兆鹏凶多吉少，整天闷闷不乐，大娘从区上的同志口中得知鹿兆鹏受伤住院了，就不停地安慰她，白灵得知鹿兆鹏已经安全脱险，她激动地抱着大娘喜极而泣。
田福贤带人把鹿子霖从地里带走，白嘉轩很紧张，又听白孝文说鹿兆鹏在西安城闹事，被打伤，估计是活不成了，白嘉轩焦急万分。
鹿子霖的家被团丁看管起来，只要一天找不到鹿兆鹏就不放他们出来，白嘉轩不顾团丁的阻拦，强行闯进鹿子霖家，并且大声喊他亲家，鹿子霖和媳妇都不敢相信，别人躲着都来不及，白嘉轩竟然还能来自己家，鹿子霖对白嘉轩感激涕零。
第二天，田福贤和白孝文眼睁睁地看着白嘉轩来叫鹿子霖下地干活，田福贤明知道白嘉轩是骑在自己头上拉屎，可是也无可奈何，白孝文也无奈，他很清楚白嘉轩什么都不怕，他们俩对白嘉轩都束手无策。
很快，白灵的预产期到了，她正在分娩的时候，县里保安团来龙湾村大肆搜捕逃出来共产党，他们来到大娘家使劲砸门。
白灵被迅速转移到地窖，保安团进来搜查的时候，大娘正在为白灵接生，她强忍着撕心裂肺的剧痛，不小心发出痛苦的呻吟，团兵很警觉。这时候，狗子故意大声哭泣，掩盖了白灵的声音，团兵搜查无果只好离开。
白灵顺利生下一个女儿，母女平安，大娘抱着白灵的女儿鹿天明，夸她仁义，她一声也没有哭，躲过了大搜查，大娘一家也都替白灵高兴，大娘告诉白灵，她之前接生的二十三个孕妇，只有三个孩子跟着母亲一起走了，其他的都让乡亲们认领了。鹿兆鹏醒来的第一件事，就是打听白灵和孩子下落。
日本帝国主义加紧对中国的进攻，南京政府步步投降，北方四省继东北之后沦亡了，共产党发布了动员全民抗战的宣言，号召国内外工农，军政，商学各界男女同胞们，为祖国生命而战，为民族生存而战，为国家独立而战。白灵和同志们一起学习了这份激动人心的宣言。
白灵要赶往桥山根据地，她不得不把女儿鹿天明留给大娘抚养，大娘一家送白灵离开，她把朱先生写给她的字让大娘交给鹿兆鹏，然后含泪头也不回地离开了。
转眼几个月过去了，白灵在根据地取得了很大的进步，不但学会了纺线，织布，射击，还教战士们学文化，受到大家的尊重。鹿兆鹏伤愈回到桥山根据地，廖军长热情地欢迎他归队，不巧的是白灵和高大鹏连长一起出根据地执行任务去了，鹿兆鹏决定等她回来，廖军长对白灵大加赞赏，根据地的战士们都在唱着白灵交给他们的歌。
鹿兆鹏来到白灵的房间，看到她给孩子做的小衣服，鹿兆鹏拿出她绣的白鹿手绢，心中感慨万千。白灵和高连长一行四人顺利完成任务，在返回根据地的路上，发现山坡上埋伏了土匪，高大鹏决定先不动声色地继续走。随后，高大鹏向山上冲锋，白灵负责掩护，他们与土匪们展开激战，很快将他们击败。
廖军长带鹿兆鹏来见毕政委的时候，毕政委当面指出鹿兆鹏的弟弟鹿兆海在中央军当营长，白灵的哥哥白孝文在保安团当营长，他不想新三十六军再延续之前的悲剧。
毕政委得到情报，红军的主力正在向章坪镇进发，眼看红军就要大会师了，廖军长很开心。由于红军对这里人生地不熟，毕政委建议派一个人连夜去接应红军进入章坪镇，鹿兆鹏主动要去执行这个任务。
白灵和高大鹏他们押着土匪俘虏得胜归来，得知鹿兆鹏刚刚出发去迎接主力红军，白灵很失落，她急忙追出去，大声喊鹿兆鹏，并把女儿出生的消息告诉他，鹿兆鹏让她等自己回来。
鹿满仓从贺家村的百姓口中听到传言，共产党的部队都打到章坪镇了，他们要来报仇，他绘声绘色地讲给村民们听，大家都议论纷纷。田福贤听说这个消息，立刻召集各村的乡约和族长开会，让他们都回去制止谣言，鹿子霖按照田福贤的提示，声明自己和共产党势不两立，如果鹿兆鹏回来，他不但报官，还要把他捆到岳维山那里，田福贤让白嘉轩也说两句话，他严厉地拒绝。
白灵一边帮战士们缝补衣服，一边向高大鹏描绘着他们一家三口团聚的幸福生活，高大鹏欲言又止，他实在不忍心破坏白灵的好心情。正好毕政委派战士找他有紧急任务，高大鹏就匆匆离开了。
田福贤派保安团的两个团兵端着枪守在白家门楼前面，白嘉轩不顾白孝文的反对，让鹿三去后院拿出梭镖，冷秋水把孩子交给白孝武，跟着白嘉轩一起出来，把团兵们骂跑了。田福贤听到这些很气愤，觉得白嘉轩让他丢人，扬言要除掉他，鹿子霖好言相劝，不让他和白嘉轩计较，田福贤声明自己是为了保护白鹿两家，才派人守着，可是白嘉轩却不明白自己的良苦用心。
根据地正在召开支队长以上的会议，白灵作为廖军长的机要秘书，想进去做会议记录，高大鹏劝她不要进去。原来，他们几次出去执行任务，都遭到敌人的阻截，毕政委一直怀疑有内奸，决定对队伍进行审查。
毕政委在全体战士的大会上宣布，由于队伍中混进奸细，造成根据地的一举一动都暴露在敌人的眼前，以及同志们无谓的牺牲，队伍受到沉重的打击，今天开始清算。没想到他们竟然对白灵羁押，还进行审查，并警告她不许居功自大，说清楚自己的问题，白灵问心无愧，并拒绝回答他们的问题。
廖军长让毕政委放了白灵，因为她是立过大功的人，而且坚信她和鹿兆鹏都是坚定的共产党员，可是毕政委却解释，他之所以羁押白灵，只是为了禁绝右倾思潮的冒头，并不是拿她当潜伏特务，廖军长和毕政委据理力争。
白灵得知他们竟然对付廖军长，气得火冒三丈，坚持要去找毕政委理论。高大鹏连夜救出白灵，要把她安全送出去。战士发现白灵逃跑，急忙追出来，白灵让高大鹏去自己的床底下拿出包袱和手枪，去找鹿兆鹏来自救她，她就等在原地被抓了回去。
鹿兆海回到白鹿原，气急败坏地来找田福贤算账，并威胁要崩了他，田福贤向他说明，白鹿两家都出了这么大的共匪，还能平安无事，都是自己在保护着。随后，鹿兆海来找白嘉轩，白嘉轩觉得田福贤还算有良心，否则他和鹿子霖早就挨整了。白嘉轩感谢鹿兆海平安送走白灵，他猜到孩子也该生下来了，得知鹿兆海也很难见到白灵，他很心痛，白嘉轩拿出白灵小时候穿戴的东西，让鹿兆海设法转交给她。
高大鹏等到鹿兆鹏，把包袱和手枪交给他，鹿兆鹏和高大鹏马不停蹄地赶回根据地救白灵。这时候，敌人冲进了根据地，并把岗哨都破坏了，廖军长下令将羁押的同志都放出来，并给他们发枪。鹿兆鹏和高大鹏看到根据地方向已经打起来了，可是他们冲不过去了，鹿兆鹏心急如焚。
桥山根据地的三十六军战士们被打得措手不及，他们拼命与国民党的部队展开激战，白灵也和战士们一起奋勇向前，与敌人浴血奋战。鹿兆鹏冒着枪林弹雨不顾一切冲向阵地。
毕政委身受重伤，白灵要背他撤出阵地，眼看敌人在他们的四周疯狂轰炸，毕政委恳求白灵一枪把他解决了，不能把他留给敌人，白灵拼命拖着他往外撤，鹿兆鹏赶到阵地，他声嘶力竭地大声喊白灵，白灵刚答应一声，只见炮弹飞过来，白灵应声倒地，被炸身亡，鹿兆鹏一下子惊呆了，他的眼前浮现出白灵小时候的天真快乐，以及青春叛逆的白灵为了去城里读书，誓死与白嘉轩抗争，还有经过锻炼坚强的共产党员白灵，后来为了执行任务和鹿兆鹏做假夫妻的白灵，往事一幕幕在鹿兆鹏的眼前闪现，他悲痛欲绝。
一早，白嘉轩冒着鹅毛大雪急匆匆来到白鹿书院，他把晚上梦到白鹿的事告诉朱先生，没想到白灵的姑姑也在夜里梦到一头白鹿钻进地缝里，他们不知道，因为白灵牺牲了，白鹿也就随之消失了。
1937年，抗日战争全面爆发，日军的战机从白鹿原上空呼啸而过，村里的老人听说日本人见村子就烧，见男人就杀，见女人就糟蹋，再加上山西和河北的百姓都到原上逃荒，村民们都惶惶不可终日。
白嘉轩把族里的壮劳力都召集到祠堂，和他们商议组建民团，白孝文从保安团调来几杆枪，白嘉轩让他们在下地之余和白孝文学习打枪，随时准备自卫。白孝文知道中央军和日军交过几次手，都伤亡惨重，他劝白孝武对白嘉轩的话就听听算了，如果日军真的打下陕西，那国家也就没了。
国民党命茹师长和鹿兆海的十一师出潼关，死守中条山。临行前，鹿兆海特意来找朱先生替茹军长求一幅墨宝，他以为鹿兆海他们是闲得无事把玩一下，态度很不屑，当他得知鹿兆海他们马上出潼关赶往中条山去打日本人，还要把他的字挂在军帐里面，朱先生很惭愧自己对鹿兆海的误解，他很清楚中条山是潼关最后的大门，鹿兆海声明会不顾一切坚守中条山，否则无颜回来见朱先生以及关中父老。
朱先生深受感动，立刻挥笔写下苍劲有力的“砥柱人间是此峰”，并咬破手指在条幅的下面按下血印，鹿兆海跪谢朱先生，并发誓要用日本人的一桶血来赔偿朱先生，他意味深长地告诉鹿兆海“王师北定中原日，家祭无忘告先生”。
鹿兆海不想父母担心，就不再回白鹿原，鹿兆海拜托朱先生把那枚铜元交给白灵，铜元他们俩一人一半，谁拿着就欠对方半个，朱先生也不想让白灵欠他的，鹿兆海担心铜元落在日本人手里就污脏了，朱先生只好答应帮他保存，并让他再回来的时候带一撮鬼子的毛发，而且是他亲手打死的鬼子的毛发。
白嘉轩来和鹿子霖都老了，也不再剑拔弩张，他们俩的关系也缓和了，白嘉轩来到戏台上找鹿子霖，他正无聊地看景，白嘉轩听说前几天有个货郎去他家了，就猜到一定是帮鹿兆鹏送信的，鹿子霖深深地叹了一口气，说鹿兆鹏又跑到山西去跟小鬼子干仗了。白嘉轩很羡慕他，两个儿子都扛着枪和日本人干仗，盛赞他是满门忠义，鹿子霖猜到鹿兆海曾经回来过，他很生气鹿兆海不来告诉自己，白嘉轩意识到自己失言。鹿子霖仰天长叹道，鹿家没人了，绝后了，白嘉轩提议让白孝文和白孝武认他当干爹。
鹿兆海的十一师在中条山和日本鬼子展开浴血奋战，鹿兆海牢记朱先生的嘱托，每打死一个鬼子，他就揪下一撮毛收起来，战士们越战越勇，很快打退了日军几十次的进攻，成功地坚守住中条山。
山寨的兄弟们和黑娃都向大拇指强烈要求下山和鬼子轰轰烈烈地开战，大拇指把兄弟们打发走，推心置腹地和黑娃说起，他年轻的时候也以为家国天下，他现在只想带着兄弟们踏踏实实过日子，黑娃笑话他怂。大拇指认为黑娃无论跟着共产党还是国民党，都会树敌，黑娃要组建自己的队伍，大拇指却担心黑娃这一腔热血早晚会害了他自己。
由于鹿兆海的十一师不是国民党的嫡系部队，把他们派往中条山的时候，配得只是汉阳造，而国民党的中央军都是美式装备，蒋介石根本没想到他们能坚守住中条山，就擅自断了他们的军饷，还冠冕堂皇地声称是让他们撤回来休整。战士们都气不过，他们不怕流血牺牲，就怕有人在背后捅刀子，纷纷扔掉军帽，脱掉军服要离开。鹿兆海担心他们会被扣上临阵脱逃和妖言惑众的罪名，受到军法处的严惩，命令他们把军装都穿好，他恳求茹师长向上面求情，茹师长也无可奈何，他很清楚，上面之所以断了他们的军饷，就是为了调他们回去和共军开战，鹿兆海气得咬牙切齿。
廖军长决定派鹿兆鹏去延安汇报工作，并特批他去龙湾村看女儿，高大鹏和他一同前往延安，他们来到龙湾村的时候，鹿兆鹏紧张地不敢进们，他是怕鹿天明长得太像白灵了，他心里难受，可是大娘带着鹿天明躲进山里了，他没有见到。突然，远处传来一阵密集的枪声，原来是国民党部队来袭击龙湾村。
日军战机轰炸白鹿原，村民们都吓得惊慌失措，落荒而逃，他们一窝蜂挤进祠堂，白嘉轩让他们一个一个给祖宗上香。白孝文看到村民们都聚在一起，担心炸弹来了把大家全炸死，白嘉轩却觉得大家在一起还可以壮胆，白孝文坚持要把村民疏散。
突然，一颗炸弹掉落在祠堂里，白孝文和白嘉轩马上疏散村民们离开，可是过了很久，炸弹也没有炸响，白孝文和村民们都百思不得其解，白嘉轩却觉得是先人在保佑大家，日本人炸不了他们，村民们全部跪下来拜谢先人。
田福贤和白孝文商量，想找一个明白人把炸弹弄出来。正在这时候，原上来了一辆军车，他们都以为是来拆炸弹的，没想到那个军人送来的却是鹿兆海阵亡讣告。田福贤不敢交给鹿子霖，就先拿给了白嘉轩，鹿子霖凑过来看到儿子阵亡的消息，他一下子瘫软在地，白嘉轩赶忙扶住他，鹿子霖伤心欲绝，哭得死去活来，他挣扎着要和日本人拼命，田福贤和白嘉轩死死拉住他。突然，祠堂里的炸弹炸响了，村民们来不及躲避，都被炸晕，等他们醒来的时候，眼看浓烟滚滚，祠堂被炸成了废墟，村民们哭喊声响彻白鹿原。