高翰文查抄沈一石的账册和家财的下落，竟一无所获，便与同来的锦衣卫分头赶往巡抚衙门和织造局。郑泌昌、何茂才正火烧账册、毁灭证据，将高翰文挡在巡抚衙门外。但让郑泌昌和何茂才万万没有想到的是杨金水还有同样四口木箱，装着沈一石二十年来所有的账册，原封不动送往京城交给吕芳，上奏嘉靖帝。 郑泌昌、何茂才等浙江的官员贪墨巨资，现在又拿不出军饷供应前方抗倭。为给朝廷一个交待，密谋移罪高翰文“办案不力，账目被销毁，大量赃款下落不明”，让其做替罪羊。 倭寇在东南沿海烧杀抢掠，戚家军数千将士在已经断粮数日后仍然坚守苦待、伺机杀敌！东南局势危急，高翰文押着仅有的军需到前方见了胡宗宪。胡宗宪敏锐地断定不出一个月，朝廷就会在浙江掀起大案，劝高翰文立刻找朝廷派来的锦衣卫主动请罪，请他们把自己槛送京师！

高翰文将沈一石临死前述说的朝廷诸多不可告人的账目一一背给海瑞听，海瑞不禁感慨官场之贪墨皆始于内廷。海瑞再次嘱咐高翰文唯有沉默，才能出狱。次日，芸娘陪同被押解的高翰文一起进京。 嘉靖皇帝几十年不上朝，但整个大明朝的财政收支却一直掌握在其手里，除了修醮炼丹以外，最让他关注的便是计算整个国家的财政收支。嘉靖帝命太监将杨金水密送进京城的四箱账册一一查点，算出浙江官场这二十年贪墨沈一石的一百万匹丝绸怎么也有七八百万两白银！嘉靖帝立即召见了星夜兼程、秘密进京、已经筋疲力尽的胡宗宪，严厉质问新安江大堤决口之事和浙江官场贪墨之风。胡宗宪忠言进谏：国事艰难，如果兴起大狱，牵及内阁和六部九司，大明朝立时大乱，恳请嘉靖帝在适当的时候彻查。 为试探严嵩，嘉靖帝又命胡宗宪将四箱账册连夜送进严府。

翌日，在玉熙宫精舍嘉靖帝召见了严嵩，将装有账册的木箱拿给严嵩看。铁证之下，严嵩也只有表示：凡沈一石账册所牵涉之人都应立刻拿办，所贪墨之财要严加追缴。 嘉靖帝当即调整了内阁。并调派徐阶的学生赵贞吉担任浙江巡抚，立即拿办郑泌昌、何茂才，追缴沈一石被贪墨的财产。 李时珍为海瑞夫妇诊脉，深得海母欢心，与海瑞一家结下了深厚的情意。桑苗刚发芽，气急败坏的郑泌昌何茂才立刻派人到各县催缴生丝。海瑞当即扣押了催缴生丝的公文。