卡卡与爱迪生偷偷来到山洞调查线索，但奈何打不开密码锁，此时他们听到脚步声躲了起来。原来来人正是柴文彬，柴文彬对此地很熟悉，并且知道密码锁的密码，显然他也是扑克牌成员之一。
二人尾随柴文彬，发现了铁门之后是一个庞大的实验室，打开电脑后屏幕上显示的都是黑桃k的字样，这让爱迪生回想起了他原来就是爱迪生，卡卡质问你不是ICIA的人嘛，爱迪生表示他也不清楚，因为记忆还有部分没回复，但是他保证绝对没有恶意。
二人正在交流，不料柴文彬突然从背后拿出枪来指着两人，说要杀了爱迪生回去复命，爱迪生在柴文彬开枪瞬间打倒了他，二人逃走，二人藏在了一个角落却发现了一具死去很久的尸体，同样是扑克牌成员，原来这个地方来过很多扑克牌成员，然后卡卡发现了一个女人用过的手机，不过已经关机了，爱迪生成功把手机打开，发现里面有一条傅筱静留下的语音，是当日傅筱静与邱子铭的对话。
录音一放出，声音就吸引来了柴文彬，爱迪生上前与其搏斗，将他的手枪打翻在地，卡卡刚刚捡起手枪就听见砰的一声，柴文彬应声倒地，原来开枪的不是卡卡，而是及时赶到的米杰，原来米杰在调查途中被人袭击晕倒，醒来就出现在了这个地方。
突然警报声响了起来，原来扑克牌组织通常会在他们的基地埋下炸药，三人匆忙逃命，结果遇到了密码铁门，爱迪生打不开，关键时刻竟然是米杰打开了密码锁。三人成功逃命，爱迪生被振昏恍惚之间想起了以前的记忆，原来是有扑克牌组织的大佬安排他复活在卡卡的身边。
卡卡与早安二人即将回到高陵市，米杰还不能离开，继续调查案件，此时齐木跑来给卡卡送画。二人转身离开，而齐木却发现了米杰脖子里的扑克牌的印记。
两人还在等火车，卡卡就告诉了早安关于爱迪生的事情，同时说出了在手机中发现的傅筱静的线索，原来在一年前，傅筱静来到东秋谷寻找爱迪生，不料却遇到了邱子铭，两人大打出手，最终傅筱静被杀，这一切都被尾随至此的俞潇看见，惊慌失措之下，俞潇逃走。
高陵市中，邱子铭罪证确凿即将被定罪，而此时ICIA也派了相村哲也来调查傅筱静的案子。相村哲也直接要求要见邱子铭，但此时邱子铭已经被别人暗杀在监狱。凶手就是黑桃A，与此同时，高陵市中的扑克牌成员也正在遭受清理捕杀。
高陵市接连发生命案，警局与ICIA的人怀疑是扑克牌在清理相关人员，相村哲也说扑克牌曾经有过这种先例，当组织内部发生重大事故事，为了安全起见，他们会自上而下的清理相关人员，以掌控事态发展。现在就有可能是这种情况，而且在这个过程中已经死了三个无辜市民，所以警察局局长下井即将逮捕黑桃A。
卡卡在家中睡醒，看到床头与哥哥的合照不仅想念哥哥，米杰至今下落不明，只留下一句目前不便回去。你们多加小心。
卡卡来到客厅才发现爱迪生撬门而入，并且进来有一段时间了。爱迪生询问米杰的消息，卡卡回答仍然杳无音信，随后爱迪生表示知道了邱子铭是怎么死的了，扑克牌组织的人先杀了三名狱警，然后冒充狱警杀了邱子铭。卡卡惊讶他们竟然这么无法无天，而爱迪生表示我都被杀了有什么可惊讶的，扑克牌组织就是一群精英主义信徒，以自我为中心，妄图创造一个乌托邦世界，并称之为推理笔记计划。
因为哥哥米杰的失踪，卡卡在学校里也显得无精打采，早安过来安慰他，却发现卡卡手机中的视频爱迪生也给她看过，说这是自杀，但卡卡却不同意，认为这是他杀，二人找到死者坠落的中新大厦图片，发现顶层是家储物公司，名叫荣茂储物公司，正是林笑家中的公司。
二人找到林笑，想要拜托他拿到储物公司的钥匙以便查案。但林笑视卡卡为情敌，不愿交出钥匙，此时早安开口，林笑才松了口，不过他提出卡卡必须找到我藏起来的钥匙，我才能让他去。对于林笑的小计谋，卡卡自然是手到擒来，很快就找到了钥匙。
为了方便查案，卡卡让早安拖住林笑，早安则去陪他看了电影。储物公司中，卡卡果然发现的打斗的痕迹，与一些血迹，通过现场痕迹他还原了当时的情况，并发现了凶手留下的手串的珠子。
卡卡与通知早安有所发现，想要告诉警方，但早安却想起了爱迪生说的，这时候警察也别信，有事ICIA的人。就在此时，ICIA的人和高大龙也来到了中新大厦，并称有人举报少年侦探在储物间杀害工作人员。
警察上楼取证果然发现了一具刚死的尸体，卡卡没有不在场证明，被当做嫌疑人逮捕了，早安正好目睹了这一幕，想要为卡卡开脱，但是没有话语权。
卡卡则提醒早安让爱迪生出面解决问题，但是现场早已经被警察控制无关人员不能入内，心急之下的早安，与林笑合作骗走了警察，早安立刻唤醒爱迪生，进来储蓄仓库才发现，齐木竟然在这里。爱迪生感觉及不寻常
爱迪生与齐木共同检查死亡现场，经过探测，他们发现死者的脖子的勒痕很奇怪，非常的干净，就像是死前没有进行任何挣扎，爱迪生判断这人应该是死前被人服用安眠一类的药物。林笑也提供了可靠的消息，死者刚来到高陵市，没有亲戚朋友，平时孤家寡人一个。
随后他们发现，死者的办公桌上有一些串珠，有水壶有过滤网，唯独没有水杯，爱迪生推测，凶手应该是在卡卡被捕这一段时间，拿走了水杯与凶器。二人一筹莫展，林笑的一句话点醒了二人的思路，凶手可以将凶器丢在了一楼垃圾场。
二人前往寻找，结果普通大海捞针一般没有线索，经过询问环卫大妈，找到了仓库垃圾所在，最终发现了一个水杯与牛皮绳。
警局中，相村哲也正在审查卡卡，他想把罪名按在卡卡头上，但卡卡据理力争，报案人指名点姓说我杀了人，这肯定是有预谋的，而解开案子的关键就在于丢失的凶器，肯定是有人通过延时杀人手法栽赃陷害，相村哲也也斥责卡卡发现线索不上报警方，同时有意无意的想询问卡卡米杰的下落，米杰直接拒绝关于米杰的任何话题，
相村哲也让卡卡为自己辩解，说出自己不杀人的理由，卡卡现场推理，死者平时孤家寡人一个，没有亲朋好友，而通过现场判断他又被人服下安眠药，这肯定是熟人所为，一个孤僻的人，谁又是他的熟人呢，卡卡怀疑是大楼的清洁工人。
爱迪生这边，发现了凶器之后，他明白的所有的杀人环节，凶手首先将死者迷晕，放入柜子中，在柜子中粘上浸水牛皮绳，勒住死者的脖子，然后牛皮绳经过一定时间变干，收缩，越来越勒住死者的脖子。最终导致死者窒息而亡。
警局中，高大龙突然收到米杰的电话，米杰称已经明白了扑克牌清理相关人员的手法，利用的多米诺骨牌规律，死者即是上一次案件的凶手，同时要求大龙帮忙。
中新大厦，爱迪生想要查询大楼工作人员名单，但死了人的大厦工作人员都很紧张，不愿透露。此时米杰偷偷传递纸条给早安，要在井泉巷见面。
米杰还不知道卡卡被关进监狱的事情，本来是想要通知卡卡一些事情。原来早安早就知道了米杰成了扑克牌组织的成员，而且米杰也怀疑早安体内人的是谁。二人坦诚相待，米杰直言应该是在稻荷村植入的芯片，米杰想要摆脱，但爱迪生表示芯片是纳米级别的，无法摆脱。爱迪生表示，早安已经找到了足够的证据释放卡卡，这个无需担心，他怀疑警局中也有内J。然而最让他们始料不及的是，齐木正在通过芯片监视着二人的一举一动。原来他才是幕后的黑手，
早安通过证据成功释放了卡卡，卡卡再次参加调查的过程，他推断，中新大厦清洁工高天成就是接下来调查的切口。