叶盈盈在孔龙和天贝的酒里都下了催q药，待药性发作将两人锁在同一间房中，想成就二人的好事。幸银花及时赶到，将孔龙打晕并替天贝解了毒。孔龙一早醒来发现自己睡在贝贝的房间，孔龙不知该怎样面对商天贝和小小，便刻意躲避二人。哼将军和银花又来请公主去见太后，银花告诉太后叶盈盈已收公主作干女儿，叶盈盈欲用计撮合孔龙及天具，差点铸成大错。太后却想办法要拆散鸳鸯。梅知府接到太后的懿旨，要替孔龙及小小撮合姻缘，择日成婚。瘟疫的灾情越来越严重，邻村已经死了几十条人命，一时间太平镇人心惶惶。衙门组织了防疫队，由孔龙来担任队长，教授村民正确的防疫措施。孔龙和华小小奉旨成婚的事情已经传遍了太平镇。天贝知道后痛不欲生。叶盈盈跑来安慰贝贝，还告诉她这件事的背后主使郎嬷嬷就是当今的皇太后。商天贝非常吃惊，没想到叶盈盈竟知道母后的真正身份，而且还与她有着血海深仇。叶盈盈答应天贝一定会阻止孔龙和小小成婚。天贝不知道叶盈盈与母后为何会如此仇恨，但她要尽快找到母后的藏身之地，并把情况告诉她。

四大高手追踪至太后曾留宿过的农舍，但人去楼空。华府管家带着嫁妆来到缘来客栈，逼迫孔龙早日向小小提亲。孔龙借口说自己担任了“杀鸡队”的队长，要立刻去各乡各镇执行杀鸡任务，以防止鸡瘟继续蔓延。叶盈盈派四大高手将孔龙捉回叶府，试图阻挠孔龙和小小的婚事。华清得知前去叶府要人，以他和叶盈盈相互勾结、中饱私囊之事相要挟。孔雀想去山西找天宝，却遇到一苇大师率领的医疗队出发去邻村为瘟疫病患医病，高勇也乔装参与其中。由于孔雀早已报了名参加医疗队，她唯有放弃山西之行。天宝和哈将军在山西发现了叶盈盈的地下兵器厂，于是飞鸽传书给皇叔商天海利，命他派兵将叛臣一举歼灭。谁知来人竟不是皇叔。医疗队一行来到了一农舍，遇上太后，孔雀劝她尽快返京，太后却先要找到天贝。太后收到哈将军的飞鸽传书说皇上在山西出了事，现在正赶回太平镇设法相救。镇门口，张三和沙捕头对进城人员一一例行检查。太后和小威子被怀疑感染了瘟疫，要被带回去隔离。金花银花本想阻拦，但见叶盈盈与四大高手迎面过来，于是将计就计，让沙捕头把太后和小威子带走，自己引开四大高手。夜晚，天贝偷偷溜进叶盈盈的房间寻找证据，却被她无意中发现叶盈盈的丹青，落款竟是父皇的印章。

金花、银花和哼将军为了不让叶盈盈发现太后，故意将四大高手引开。叶盈盈穷追不舍，银花为了掩护哼将军与金花，受伤堕后，被叶盈盈捉回叶府，逼她说出太后的下落。天贝无意中在地牢发现被打得不成人形的银花，她求叶盈盈放了银花。天贝找到孔雀，告知皇兄遭难。孔雀与高勇动身返回太平镇寻找太后。天贝将受伤的金花与哼将军藏于缘来客栈柴房，便和孔雀一起到隔离营打探消息，原来守营捕快收了小威子的银子，早已将太后二人放走。太后到衙门，想表明身份，调兵救天宝，但孔雀与天贝不想打草惊蛇，及时赶到，阻止了太后。孔龙带着“杀鸡队”继续在邻村执行杀鸡任务，在一破屋内发现已被毁容的天宝。原来当日天宝在山西与皇叔相见，中了敌人埋伏，被引爆的炸药烧伤。孔龙答应一定将天宝医好。太后病倒，孔雀发现太后似是中了瘟疫。可治疗瘟疫的药已全部用光，而用来配药的药引“鱼腥草”已经给华清全部买光了。小小回家向父亲讨药引，华清不肯，还把小小关了起来。孔雀以“燕子装扮”去华府盗药。孔龙也尾随孔雀至华府。姐弟决定分头行动，孔雀设法引开华府众家丁，孔龙则负责找药。华清没有把鱼腥草放在药房，孔龙只好空手而回。华清手里拿着孔雀留下的“金燕子”标记，怀疑女飞侠还没死。