维斯在恐怖活动中被击昏后，阿露特替他驾驶直升飞机。璐基诺负责舰船“阿斯拉”的掌舵。机动六科现在的任务是搜索圣遗晶石和解救银河及薇薇欧，但目前没有进展。地面总部的兵器“战魂”受到战斗机人的破坏。艾克斯督察官和沙赫发现了斯卡利艾迪的老巢，并与拓发者发生激战。艾克斯督察官趁着激战向机动六科通报。乌诺将薇薇欧放入王座后，“圣王摇篮”开始驱动起来……

巨舟浮起后，克洛诺的次元航行舰队已展开行动，机动六科也同时展开行动阻止巨舟浮起。而最高评议会还在谈论斯卡利艾迪的事情。疾风很清楚最高评议会、雷吉亚斯、斯卡利艾迪三者的复杂关系，所以机动六科全员才被紧急出动，先锋们被派到地面与战斗机人以武力解救银河和逮捕战斗机人。奈叶、菲特、维塔、疾风四人在卡莉姆的限定解除的情况下，在巨舟外部寻找突入口。三名最高评议会成员全部被都艾杀害。

疾风指挥局员们与巨舟外面的拓发者进行战斗，奈叶和维塔也终于找到突入口进入内部。菲特和沙赫在斯卡利艾迪的老巢进行战斗，寻找斯卡利艾迪。先锋们成功地派到地面与战斗机人发生激战。但是蒂安娜被关在结界里，艾力奥和凯洛面对璐缇希娅的战斗，昂则面对银河进行难以选择的战斗。奈叶和维塔在巨舟里分头行动，维塔前往驱动炉，奈叶前往王座大厅。先锋们与战斗机人、璐缇希娅、牙龙、银河等人陷入苦战。希格诺和扎斯特初次相遇发生激战。 距离“摇篮”到达轨道地点还有2小时16分。