一股来历不明的势力阻止机器洞察一件即将发生的灾难事件的全貌，机器同时吐出五个不同的号码，Finch的团队只能自行调查相关线索并解开这个谜团。与此同时，Root的黑客团队抵达纽约。
邪恶的人工智能项目“Samaritan”即将上线运行，Finch和他的团队会成为它的首批目标，这迫使他们采取一切可能的行动来阻止这件事情的发生。与此同时，他们与反监控“恐怖”组织Vigilante长达数月的战争有了一个令人震惊的结局。
