时间能让一切飘然逝去，就像短暂的风声瞬间即失，如果时间可以倒流，顾晓梦想没有人会愿意踏进那艘船。
那时24岁的顾晓梦刚从普林斯顿大学数字系毕业，之后经过剿总司令部特训班培训结业，到司令部接受考核，出的考题是10分钟内找出左右两边的人谁是偷盗情报的间谍，经过缜密推算，顾晓梦很快找到了正确答案。这时剿总司令部机要处处长金生火走了进来，安排给顾晓梦加一道译电测试，如果测试成功，直接抽调档案进入机要室。属下提醒他，按照规定测试通过后，人事处要重新审查背景后才能正式入职，金生火认为顾晓梦是苏杭船王顾民章的女儿，而顾民章是南京国民政府经济委员会副会长，也是汪主席的座上宾，所以他女儿的政治背景根本无需大动干戈调查。最终顾晓梦以4分23秒的速度破译出了密码，金生火告之她是第二个取得这样好成绩的人。
属下让金生火指示日军司令部情报处组织的业务研讨会派谁去，金生火让他随便找个人应付一下。他得知顾晓梦被分到司令秘书处了，十分不悦，属下告诉他，这是张司令定的新规定，人事调动除了他签字外，还必须要经吴大队长同意，金生火立即给赵处长打电话，称吴队长忙着剿匪清乡的事顾不上新人的分配，如果顾晓梦分到秘书处，把现在的秘书白小年如何安置？白秘书和张司令的关系非同一般众所周知，赵处长略一思忖，同意让顾晓梦到机要室。金生火立即安排下属找赵处长办好交接手续亲自送到鸡鸣寺，并找鸡鸣寺的孙处长务必打听下副司令的人选。属下提醒这次的研讨会吴队长也去负责安保警戒工作，金生火立即改变主意让他通知张司令，自己和新任科员顾晓梦都去，机要处一定要在日军情报处面前，替张司令把脸面争回来。
日军司令部情报处组织的业务研讨会在一艘船上举行，剿总司令部出席的人员是机要处处长金生火、情报科科长李宁玉、科员顾晓梦和行动队长吴志国，满洲国保安局第五课专家金圣贤也参与其中，会议人员到齐后，日本陆军情报部第二课课长三井寿一宣布：他们刚刚截获了一条密电，谁最先破译该条密电就破格进衔。此刻另一边的船舱外，顾晓梦在用微型相机拍摄海景。
在所有破译专家都埋头破译时，李宁玉不屑地说，这是德国的恩尼格密码，而且是二代密码机加密，单靠他们手工破译，两年也算不出来，在大家目瞪口呆时，日本陆军情报部次长森田鼓着掌从二楼走下来，称赞说他等了13分钟，终于听到令自己满意的答复了。
船舱外，吴志国质问顾晓梦，这种微型相机全司令部只有两台，顾晓梦拿着要拍什么，顾晓梦解释是为了搜集研讨会的学习资料，吴志国要把顾晓梦和相机押到森田处。顾晓梦走时说听闻吴队长年轻升得快，是因为军功多杀人多，不是因为会巴结日本人，吴志国立即以迅雷不及掩耳之势杀死了一只海鸥。
船舱内，森田称赞说李宁玉不亏是汪主席的王牌破译员，李宁玉笃定森田让他们从截获的密电中推出德国第二代恩尼格玛机的构造，没有密码机，单靠手工暴力破解，绝无可能。如果森田想在短时间内破译，必须拿出初代密码机，包括紫密，才有可能完成复制机。此语一出，森田立即认定李宁玉是敌方的间谍，这种说法是为了刺探日方密码机的秘密，她只给李宁玉三秒时间坦白，正在这时，吴志国把顾晓梦押了过来，森田认定，顾晓梦和李宁玉都是金生火的下属，一个违规带相机拍摄，另一个想方设法索要密码机，这都是金生火精心策划的敌特行动，金生火非常冷静地让顾晓梦说出李宁玉的名字，之后解释二人根本不认识，更谈不上默契配合，如果他想拍摄资料，完全可以把最先进的照相机安装在雪茄盒、烟灰缸等隐秘物品里，没必要让顾晓梦明目张胆地带着它。李宁玉说出了森田走路的步数，称自己的记忆力非常好，如果想记忆过目不忘根本不需要相机。森田称这是顾晓梦的私人行为，让把她押下去，顾晓梦边走边说随机选取 三个数字做为解密触点，果然听到后森田把她留了下来，顾晓梦称自己是冯诺依曼教授的学生，而德一代密码机的制作者施伦堡在遇见父亲之前是个穷学生，他和自己非常熟识，如果她想窃取密码应该是在施伦堡办公室而不是在这里。李宁玉证明顾晓梦说的是真的，因为一代密码机已经泄露，所以施伦堡惠而不受，合情合理。虽然她没有证据，但相信森田一定有，否则为何日军近几次战役节节败退，这就是初代密码机泄密的有力证据，森田暴怒，称如果这次的破译代价是她们的生命，是否还要冒险，李宁玉斩定截铁地说如果不能破译二代密码机她负全责，金生火也愿意以自己的性命赌这局，森田给他们96小时，时间到如果没有破译成功，全部处死。
森田走后，金生火提醒在座的各位，如果能够成功破译皆大欢喜，否则今天参与破译的都将是情报处的替罪羊，他这话一出口，破译专家们纷退出，只有顾晓梦愿意留下来协助李宁玉，而金生火则没事人似的出去抽烟了。
金生火到舱外与吴志国聊天，感谢他把顾晓梦带到森田面前，让自己有一个申辩的机会，否则他一离开会议室，定会死得不明不白，吴志国称他该感谢的不是自己，他对走来的顾晓梦说好自为之。金生火问顾晓梦为何要带相机还一口咬定是自己授意的，顾晓梦只说害怕所以用他卖森田的面子，金生火纠正她森田今天的网开一面不是自己的面子而是李宁玉。即使顾晓梦进了日本人的审讯室，他父亲给汪主席一个电话也就出来了，而自己背靠冰山是九死一生，这艘船就是开往地狱的。
金生火告诉顾晓梦，李宁玉的丈夫在西安事变前病重身亡，她随之脱离了与四维学会的关系，再赴德国进修电讯专业，次年回国，与英国的驻华大使馆高级翻译就是现任丈夫结了婚，投在了钱司令的门下，后来日进英退，丈夫不得势了，随着钱司令改换门庭，顾晓梦感慨李科长运气真好，步步险棋都能化险为吉，金生火称他们这行不能单靠运气，李宁玉入职不过四年，苏联、军统、共产党的密码都破译过，在机要处没有她破不了的电文，去年的青岛会谈，多亏她提前破译了中统的刺杀令，才使汪主席幸免遇难，连丁主任称赞李明玉能顶上整个76号外加一个特高课。顾晓梦明白了，原来她考试时金生火说比她成绩好的人就是李宁玉，金生火还告诉她，李宁玉不仅业务过硬，人也是风情万种，吴志国就是她裙下臣之一。而这次日本人安排的破译任务，如果她破译不了，森田会把参与者处死，如果她成功破译，日军为了保证新密码机的机密，还是会把她杀掉。顾晓梦终于明白为什么金生火不参与破译了。金生火告诉她，日本人因为想要掌握他这个德国盟友高层的机密，无论李宁玉是否破译成功，都会被杀掉，这才是日本人把这次业务研讨会开在船上的真正原因。顾晓梦安慰金生火不要那么悲观，如果他有逃出升天的计划，自己一定全力配合，金生火答应保她周全，问她谍报工作的职业生命是什么？顾晓梦答是信仰，金生火告诉她是生命，保住自己的性命比什么都重要。
另一边的吴志国一直在破译室外守着李宁玉，他甚至幻想着自己为保护她大开杀界的场景。金生火告诉顾晓梦，从现在起，不要和李明玉有任何接触，马上将相机事件写一份检讨书，向张司令请求处分，之后去找吴志国，他们的计划如果没有吴志国的配合，完全是水上堆沙。
顾晓梦刚站到吴志国舱外，就被他一把推了进去，他已料到顾晓梦是受金生火授意来找自己，其实对这次的死亡任务，吴志国心知肚明，却佯装事不关己，顾晓梦提醒他李宁玉也身处险境，只要他肯配合，金处长有办法让大家搏出一条生路。二人来到金生火舱内，金生火非常高兴地拿起酒和吴志国碰杯，杀气腾腾的吴志国却把琉璃杯捏得粉碎，金生火安排顾晓梦立刻写检讨书，吴志国奉劝他别害人害己，金生火解释他是救人自救，没功夫害人，吴志国拆穿他身为机要处处长，检讨书一发出去，张司令就得看在顾民章的面子上放人，那时他和顾晓梦就可以一走了之，顾晓梦也提出质疑，，她不想把李宁玉这个破译天才挡在自己面前，金生火称三人如果结盟同生，背盟共死，愿意相信自己还是背叛，他们自己选。吴志国又说出金生火是想当副司令的人，如果得偿所愿自己就得死，金生火称自己能救了顾民章的千金，副司令的官职也太小了。他计划第一步救自己，第二步救顾晓梦，第三步就能救李宁玉，因为他已经找到了破解二代密码机的方法。此时另一边的金圣贤拿着李宁玉验算的稿纸，向森田告状说李宁玉根本破解不了二代密码机，她是想假借密码机窃取机密，而自己退出是为了拿到李宁玉延误破解工作的证据。
金生火安排吴志国将自己破译的德军电文带给李宁玉，他猜到日军不到万不得已，不愿和苏联开战，所以他们情报部急于破解二代密码，应该就是为了监控德军对苏联的战略动向，所以只要他们破解的这份电文是与苏联行动有关的，森田就会相信，至少李宁玉可以过了眼下这道关。而日方要验证电文是假的需要三个条件，第一要有密码机的内部结构，第二要有德军的操作守则，第三要有德军发报员发报前所要执行的密码口令，而他们每天更换一个口令，所以要破译根本不可能，只能靠间谍窃取。因此只要日军间谍没有窃取到当日的口令，他们就没办法验证密码的真伪，就为他们争取了时间，再加上汪主席和顾民章的保护，他们三条命应该可以保下来。之后让吴志国马上发电报，李宁玉再宣布改装成功，吴志国随便再杀一个人，让他们相信船上混进了特务，而敌特行动归陆军特务机关，情报部必然不愿意让他们插手，所以他们情愿息事宁人，这样破译的真假就不会再追究了。吴志国提出一个问题，李宁玉连七十六号的禁闭室都敢下，这样的人让她拿假电密逃命不大可能。他的建议是杀出去，第一步挟持森田，第二步杀几个人，第三步抢到后舱的救生艇一起走。金生火称比起吴志国的计划，还是自己的弄虚作假体面一些，即使能逃出去，一辈子也要隐姓埋名当逃犯，李宁玉必是不肯的。这时吴志国下属悄悄向他汇报了金圣贤向司令告密的事，现在森田正要审讯李科长。吴志国立即赶去，金生火让顾晓梦带着检讨书一起去。三人看到森田正怒气冲冲地往破译室走，吴志国想办法拖延时间，让晓梦和金生火去找李宁玉通个气。
吴志国拉响了机电室的警报，把森田吸引了过去，顾晓梦立即溜进会议室，告诉了李宁玉来龙去脉，让她赶紧拿着金生火伪造的密电，向森田证明自己已经破译了二代密码机。
森田这时接到总部来电，称船上有人用不明电台发报，被总部截获了，他们相信船上混入了特务。森田立即提审了李宁玉，认定她不仅窃取了初代密码机的机密，而且还用发报机把它发了出去，因为刚才有人盗用了机电室的发报机，向不明电台发送了情报。李宁玉脸色苍白生气她为完成森田下达的任务不眠不休，却被他们如此诬陷，金圣贤指控说她的演算都是在初代机的构造机密上，李宁玉解释他只在销毁前拿到了一张稿纸，如果拿到其他三张，就会明白她是由初代机的构造推算出了二代机的密码规律，而且如此高级别的密码，岂是他三言两语就能向局外人解释清楚的，自己更不可能只用一条电文就能把它发送出去，而是会活着下船，亲手交给上级，不会冒这样愚蠢的风险。金圣贤无法自圆其说，于是咬定李宁玉根本破解不了密码，李宁玉则宣布她已经破解了。金圣贤不服气地要亲自验证，李宁玉称结果验证成功，就必须解除她窃取情报的嫌疑，如果验证失败，她愿意认罪。很快验算完成，金圣贤让李宁玉亲自为森田大佐翻译。
金圣贤验算完毕后宣布验算失败，称李宁玉不可能完成二代恩尼格玛机的改装，森田刚下令立即带李宁玉去审讯室，士兵汇报说在金圣贤舱内发现了李宁玉的演算稿纸，上面有二代机的改装字样。森田看了一眼大喜，称译出了苏联就说明没有完全失败，他下令立即找军医治疗李宁玉的哮喘，之后向金生火证实了李宁玉确实有哮喘的病根，森田称赞李宋宁玉确实是位破译的天才，只要他们足够忠诚，不会浪费他们的才华。
李宁玉沉睡了七个小时，醒来后，看到吴志国守在床边，他告诉李宁玉：森田下令，她睡的这段时间不算在任务时间之内。为阻止李宁玉破译，吴志国把她的右手划伤，李宁玉表示只要还有命在就不会停止破译，吴志国疼惜地帮李宁玉包扎手上的伤口，称他能挟持森田，抢到船后的救生挺带她走，而金生火只想攀附顾民章，根本不是真心想帮她。李宁玉坚定地说她不走，她的命在密码里，吴志国的命在刀尖上，逃不脱就不要说谁带谁走的话。二人正僵持着，顾晓梦闯了进来，吴志国悻悻而去。李宁玉问顾晓梦来情报处的目的，顾晓梦称自己是为了她这个破译天才，想变成和她一样的人。她忘不了那日，自己带着金生火的那份假密电想让李宁玉用它逃生，李宁玉却气愤这种做法是在侮辱自己，指责顾晓梦比金生火更可耻，顾晓梦生气李宁玉为了自己的天才虚荣要拉着所有人陪葬，李宁玉骂顾晓梦是个蠢货，自己破译不是为了加官进爵，在她眼中，谍报的的职业生命是毁灭，毁灭一切正义和邪恶，信仰和背叛，如果有不能破译的密码，就把自己投进火里，让它烧得更热，更烈，直到烧成天书。
顾晓梦告诉李宁玉，她把假密电藏了起来，一时半会金生火和吴志国不会再来逼她了，顾晓梦拿出从军医那买来的止咳约让李宁玉服下后，李宁玉立即出舱继续破译。
顾晓梦回舱后回忆，金生火曾经告诉他，森田根本没想查假密电的事，他是想玉石俱焚，一网打尽，当下的唯一办法是把军统间谍的罪名都推给李宁玉，所以才安排她马上到顾晓梦舱房取得她的信任。顾晓梦正在思绪乱飞，三井寿一过来称李宁玉受了重伤，无法继续破译，点名让顾晓梦过去协助。
虚弱的李宁玉告诉顾晓梦，现在还剩不到十个小时，她来发指令，李宁玉操作，选中她，是因为她想成为像自己一样的人。此刻的金生火正在舱内和吴志国聊天，吴志国告诉他，自己发的电文里没有涉及金生火，但张司令接到一定会赶过来。
森田收到日方总部截获的电文，是用不明发报机发给剿总司令部的，三井寿一由此怀疑间谍就在金生火一行人中，森田认为他们不可能愚蠢到不顾一切地发报，而且二代机没有破译，他们没有发报的必要，三井寿一提醒这种事应该立即报备特务机关，而森田已经失去等待的耐心了，他根本不关心李宁玉是否破译成功，只希望中国的天才越少越好。
李宁玉殚精竭虑，时刻提醒顾晓梦，一个指令错误就会前功尽弃。另一边的金生火对吴志国说，李宁玉如果不愿用自己的假密电，只有等张司令这把尚方宝剑了。
森田收到剿总司令部的电报，张司令要上船亲自监督，他命令将船立即停靠等待张司令。此时距离约定破译时间还有七分钟，在最后时刻，李宁玉完成了改装，她请示森田将所有专家都叫过来一起验证，因为迄今为止恩尼格密码机是人类密码的最高峰，如果她可以破解二代密码机，说明人类的智慧可以战胜机械，他们就有了存在的价值，她希望谍报专家来共同见证这个时刻，如果自己失败了，必将上下而求索，死而无悔，将激励他们继续破译恩尼格密码机。顾晓梦申请森田不要通知金生火处长，因为他只是个官僚，早不配称为谍报人员了。
所有专家到齐后，李宁玉让顾晓梦进行验算，森田当众宣布验证结果：李宁玉成功破解了二代恩尼格密码机，她的大脑战胜了机械，疲惫的李宁玉咳嗽不止，很快昏睡过去。金生火和顾晓梦、吴志国三人举杯为此庆贺。
船到港后，剿总司令部张司令的机要秘书白小年来了，金生火告诉他，千方百计把他请来，是因为这帮兄弟需要他来救。