万事屋再次卷入麻烦的事件中，除了银时、新八、神乐三人外，其余的人和一切事物都被停止了，世界陷入一片死寂。而这一切都是银时捡到的外星时钟所引起的，只有修好时钟世界才能恢复秩序。万事屋三人找到源外老头子家，银时想出了拨动时针跳跃到未来的方法，这样时钟就能被修好了，然而这个方法能奏效吗？

银时等人发现世界时间停止竟是因为“三千世界时钟”没电了，于是他们三人尝试换块电池，却发现这种特殊的电池似乎不是地球上的东西。为了寻找备用电池，银时等人拿着时钟赶往事发现场，然而电池被静止的土方紧握着，根本无法取出。万事屋成员能顺利将电池弄到手吗？世界危机又能否解除？

真选组的山崎对万事屋进行全方位的监视，然而日复一日的光景让山崎感到了厌烦，就在他万念俱灰之时，机器女仆小玉的出现让他眼前一亮。山崎无法自拔地迷上了小玉，甚至发展到成了跟踪狂的地步。得知此事的总悟向银时提出让山崎和小玉相亲，于是剑拔弩张的相亲大会开始了。