张副官和齐铁嘴查出有关病毒和陨铜的线索，这一切答案都表示日本人就是始作俑者，而在洞庭湖附近的沉船，则可能是制造病毒和陨铜所在的关键位置。张启山感觉日本人将会有对长沙不利的大行动，事不宜迟，他决定和张副官亲自前往一探究竟。
两人来至洞庭湖处打探消息，在一处客栈得知附近有一沉船被日本兵捞起，船上有十分贵重的东西，但是这船被转移了，目前下落不明。客栈老板收了张启山不少钱，心里一高兴，便向他俩透露更多消息，更提出要带他们到一个储藏鱼虾的冰库，因为很多人都在那里找到了宝贝。
张启山和张副官跟客栈老板来到冰库，在里面偶遇一位在冰库玩耍的小女孩。小女孩大情大性，性格活泼，跟张启山很是投缘。在小女孩向张启山求水解渴之后，见其水瓶精致，于是掏出一精美耳环欲与其交换。张启山一看之下，发现这耳环绝非便宜货，于是便问小女孩怎么得来的。小女孩也不避忌，直接把张启山带到一贩卖宝物的市集。
市集的商贩口紧得很，张启山问不出什么来，只好先把宝物买下再算。小女孩翠翠惊讶于张启山出手大方，张启山顺势掏出一袋银两，想收买翠翠，让她透露这些宝物的来历。翠翠知道这涉及到村民的生计，担心会影响乡亲们，但见张启山和张副官态度诚恳，于是告诉他，可以去村东头的客栈问问。
张启山根据翠翠的线索来到村东头的客栈，在此处不仅看见之前失踪的黑石，还有陈皮。张启山偷听他们的对话，得知陈皮跟一群日本人一起来，跟黑石汇合，似是有什么阴谋。张启山从他们的对话得知黑石、陈皮还有日本人狼狈为奸，于是在他们摸黑出外活动时偷偷跟在背后，发现他们来至一洞。
张启山暗中观察他们，发现他们竟然在洞里头暗中炼制病毒，原来一切的根源，都是日本人所为。为了阻止日本人的野心，张启山打算出手阻止，不料在潜伏时被发现，于是以一敌众，跟黑乔的人打了起来。张启山武功高强，把黑石杀了，但自己却不小心误中陷阱，昏了过去。张副官则在另一边厢逃避陈皮的追捕，随后折返找张启山，却发现他在冰崖下昏迷不醒。张副官把张启山救出打算离开，这时遇到翠翠，翠翠说他们的朋友在外面等着。原来二月红担心他们的安危，于是带人前来支援。
二月红和张副官谈论时提到日本人，翠翠突然哭了起来。原来翠翠是个命苦的孩子，她的父亲被日本人所杀，张副官和二月红听后，心里更是立下决心，要追随佛爷，救老百姓于水深火热之中。
张启山被村民的土方法救治，终于苏醒过来。张启山、张副官和二月红继续在此地查探日本人的阴谋，无意中发现黑乔人在祭天，随后在他们口中得知陈皮等人行进的方向。三人继续前行，路上发现一处树葬的地方，树上的尸身死状怪异，似是中毒身亡，让人不禁推测他们被日本人拿来做实验。三人继续深入探究，天色开始入黑，他们来至一个村寨，在里面发现有两个小棺材。张副官认出，这两个棺材的形状，应该是之前帮时怀婵下葬世子时被盗走的棺材。眼下真相越来越近，他们继续深入，不料此时被埋伏起来的黑乔人袭击，张启山和二月红昏倒在地。
张启山和二月红中了埋伏后，便被黑乔人囚禁起来，同被黑乔人囚禁起来的还有附近渔村的村民。好不容易恢复清醒，却看见陈皮出现在此，对他们奚落一番。待陈皮走后，张启山和二月红便施计逃离牢狱，顺道把村民们一起救走。
陈皮从后追上他们，打算对他们痛下杀手。二月红见自己教出来的徒弟竟然如此心狠手辣，感到痛心疾首，于是也不手下留情，和张启山联手把陈皮等人打个落花流水。
二月红之前路过一荒废小屋时，看见一些从沉船处打捞的宝物，打算先拿回去再慢慢研究，而这些宝物在二月红与陈皮打斗时，不小心散落在地。陈皮从宝物堆里发现里面有一个簪子，跟之前自己送给师娘丫头的一模一样。陈皮质问二月红这簪子为何出现在此，却反遭张启山的呵斥。原来这簪子有毒，想必当时丫头病重，就是毒簪所致。
陈皮对自己也产生了怀疑，但是固执的他坚持把丫头的死因归咎于张启山的见死不救，随即继续攻击张、红二人。就在千钧一发之际，渔村村民们对两人伸出援手，大伙儿合力赶走陈皮。
陈皮拿着毒簪回到自己的落脚点，随后问同伙的黑乔人这毒簪从何而来。黑乔人见到毒簪后十分惊讶，说这毒簪是属于那批最早从沉船处打捞出来的宝物，毒性十分强，之前曾经流入黑市。陈皮不禁想起，当时这簪子就是自己从黑市买来送给师娘的，当时还因自己光顾黑市而受到二月红的责备，陈皮在被罚跪时气上心头把簪子砸烂了，师娘捡起簪子时不小心割了手，因此染上病毒。陈皮这么一想，才发现丫头的死，竟然是自己所为，这让他一时之间难以接受。
陈皮如今也因被毒簪所致染上病毒，身体渐渐吃不消。张启山知道后，打算让张副官把他带回救治，但陈皮却不领情，跳车逃跑了。张启山担心他会把病毒传染给人，决定在城中进行戒严，并尽快抓到陈皮。
张启山在尹新月和二月红的建议下，问五爷借了狗来追踪陈皮，但还是被陈皮逃脱了。陈皮来到手下们的住处暂时躲避追捕，稍稍休息几天后，便继续部署杀害张启山的阴谋。
狡诈的陈皮十分难捉，张启山和新月决定演一出戏引陈皮上钩。张启山先是让人把“真正的鹿活草被新月藏于新月饭店”这一假消息散播出去，随后新月故意跟张启山为了当时不把鹿活草给丫头一事吵了起来，更是说要回北平娘家，然后故意把吵架的内容让八卦的下人听见，使得这消息传遍长沙。陈皮听信谣言，认为新月才是始作俑者，于是根据传言，截住要“回北平”的新月，打算为师娘报仇雪恨。陈皮中了张启山和二月红事先设下的圈套，来到一处荒冢里，被墓冢的机关关了起来。二月红则把解药投进密室，至于陈皮是死是活，则看他自己的造化了。
陈皮在密室里已经半死不活了，但他依旧向二月红大喊，说自己死了没关系，但二月红一定要把找到陨铜救活师娘，这让二月红动了恻隐之心。张启山担心二月红再次被陨铜制造的幻想所困，于是打探他心中所想，而二月红则表示自己已经接受了丫头已死的事实。陈皮命不该绝，但他与二月红从此再无瓜葛。
张启山把齐铁嘴带到白乔圣树，把圣树的秘密告诉他。原来圣树可以让尸体终年不腐，是因为树下埋有陨铜所致。青乌子的卷宗里用古乔语书写，也可能与此有关，卷宗上就记载着圣树下埋有陨铜。
裘德考也得知第三块陨铜就埋在白乔圣树下，于是前来打算挖树取物。裘德考徒手挖掘时，挖得一块铜片，上面画着一地图，并写着“镖子岭”，随后裘德考便下落不明。而田中也被陈皮铲除了，长沙暂时平静了一段时间。但好景不长，过了几年，日本人开始在全国各地进行袭击，长沙也即将成为战场。
心系国家和民众的张启山自然要和弟兄们站在最前线，但为了新月的安危，他忍痛暂别爱妻。新月看着张启山的背影，她决定留在长沙等着他，不回北平避难。
二爷、三娘、八爷、九爷在战前享受片刻的欢乐，聚在一起打麻将。日本人的飞机声不断传来，但见惯大场面的九门中人十分淡定，似是安心地享受这暴风雨前的宁静。
如今长沙不再太平，长沙民众纷纷逃走躲避战火，九门中人也只能暂时离开，待日后有缘再聚首。天下无不散之筵席，张启山没有阻挠大家的离去，但他希望大家在日后，可以帮忙照顾自己的夫人。佛爷的话语一出，似是做好以死一搏的准备。
张启山在萧条的长沙城独自走着，回忆起很多往事。他想起当时南下逃难的自己，还有死去的父亲，还有和九门中人的相遇情景。如今回想，一切都历历在目，可惜因为日本人的袭击，让这原本充满欢声笑语的长沙城物是人非。
日军终于攻进城内，敌众我寡，敌强我弱，张启山和一众兄弟血战一番，依旧抵挡不住魔鬼的步伐。尽管张启山引爆了事先埋伏的炸弹，杀了很多日寇，但对方兵力彪悍，不断有新的日军涌进长沙城。然而张启山身边只剩寥寥可数的亲兵，他决定不退缩，跟大家死守长沙。就在此时，九门的各位出手相助。原来大家没有离开长沙，都留了下来，帮张启山一起抵抗日军。
九门的传奇一直在长沙城内传颂着，多年后，大家还会记得在那一九三九年的秋天，有一位叫张启山的人，带领大家捍卫家园。（全剧终）