祁钰见到允贤与皇上深夜独处，黯然神伤，并向他宫中的锦衣卫朋友探听了此事，得知皇上的确对允贤有眷恋之心。汪国公暗中设计离间皇上与郕王，却意外打听到允贤建议皇上扩建御药房，好为宫内的宫女太监开诊布药的消息。朝堂上，皇上向众臣提及此事，众多老臣一听皇上要改革祖制，纷纷表示反对，继而扯出允贤掌管御药房却越职为宫人们诊病的事，大肆参奏允贤，还将允贤说成不堪之人。皇上听臣子们如此侮辱允贤，且不把他的话放在眼里，大怒，与朝臣们大起争执，还下令将反对的臣子都拉出去杖责五十。太后闻讯赶到，制止皇上责罚朝臣，并宣布扩建御药房之事就此打住，还让朝臣们就此退朝，皇上让朝臣们回来，却根本无人理会。

祁钰听说了朝臣们在朝堂上对允贤群起而攻之的事情，急忙去找允贤，劝允贤辞官出宫，允贤因家族旧案未翻，皇后又还未怀上龙子，遂不愿辞官。不料祁钰竟对允贤说出“花蕊夫人”的典故——宋太宗与宋太祖共争一女，以此暗示如今皇上与他争允贤，见祁钰如此怀疑自己，允贤伤心不已，让祁钰离开御药房。祁钰前脚刚走，太后就派人传召允贤。因皇上为了允贤不惜与群臣大起争执，太后竟欲用毒酒将允贤赐死，皇后赶来为允贤求情，却被太后推到在地，磕破了头，允贤赶紧上前为皇后把脉，竟发现皇后或有喜，皇后以允贤为她调理身子有功且龙胎安全有赖允贤保障为由，请求太后一定要饶过允贤。程十三与刘平安同时前来为皇后诊脉，程十三谄媚，只贺皇上有了龙嗣之喜，刘平安则如实道出，皇后因为受了惊吓需要好好保养，否则将有滑胎的危险。皇上问宫女皇后怎么会受到惊吓，这才知道太后欲杀允贤之事，于是皇上也撂下话威胁太后——如果允贤有事，他亦不会放过太后的外甥女安和郡主。

汪国公在太后面前再进谗言，鼓动太后除去皇上，太后想到皇上对她的威胁，亦觉得等皇后产下龙子皇上也将可有可无。王振挑唆皇上，说允贤此次之所以差点丢掉性命，全是因为汪国公汪英在背后使坏，鼓动皇上派人暗杀汪国公。皇上将欲除去汪国公之事告知皇后，皇后却大力劝谏，皇上一时气愤，失手将皇后攘倒在地，皇后又一次险些有滑胎之忧。皇后仔细向皇上说明不可杀掉汪国公的原因，皇上遂答应皇后收回成命，王振则不得已叫曹吉祥撤回东厂杀手。