允贤跟随王道士学医，大有青出于蓝而胜于蓝的势头。允贤打听得知奶奶及父亲并没有回老家，又听王道士说祁钰因她而一病不起。为了开解允贤，王道士说出了自己之所以出家为道，行走江湖的原因——他曾与一官家小姐相识相爱，但就在他们私定终身准备成亲之时，该小姐的家人找到他并告诉他他的心上人即将嫁作他人妇，他以为自己遭到了爱人的背叛，一气之下去亲戚家散心，不久，竟听说了心爱之人在成亲当晚自尽而亡的消息，他因此而悔痛不已。允贤听了师父以身说法，为了不让自己的人生留下大憾，决定回京城寻找心爱之人——祁钰。
太后大病后身子未大好，军事大权回到皇上手中，皇上决定立即发兵征讨安南。允贤回到京城，得知父亲及奶奶已被义父于东洋接到府上照料，且义父已去河南上任巡抚，父亲及奶奶亦随同前往，而祁钰则被皇上接到宫里居住。皇宫张出皇榜，欲寻民间圣手给太后治病，可一般民间郎中没有推荐函又无法进入内宫。郑国公家的小儿子患上了“厌食症”，访遍名医仍不见好，允贤扮成道姑去国公府上为小公子治好了“相思病”，允贤不求重金，但求郑国公为她写“荐书”让她进宫给太后治病，继而寻找祁钰。国公因允贤来历不明有所迟疑，而来国公府上给小公子治病的太医刘平安却愿意为允贤作保，并与国公合力安排允贤以“医婆”身份入宫为太后诊病。
各位受荐进宫的民间圣手依次进仁寿宫给太后看诊后，为如何加减调药讨论起来，允贤说出自己的见解，却被众男大夫调笑为女流之辈。大夫们将调好的药呈给太后服用，太后因药苦而大动肝火，下令将众大夫都拖出去打二十大板后赶出宫去，允贤则说自己能做出不苦的药。
为了让太后相信自己的确能做出不苦的良药，允贤先将一香包呈给太后，太后闻后觉得心旷神怡。允贤请命再次为太后看诊，以求诊断确实。给太后诊断出病情，允贤说去熬药，实际上却是给太后做了几道“药膳”，太后吃了之后，觉得的确爽口舒心，于是心情大好，赏赐给允贤一袋金瓜子。允贤将太后赏赐的金瓜子赠给了宫女玉香及太后身边的其他宫女，以谢玉香告知她郕王在宫中的住处——北五所。钱皇后亦欲赏赐允贤，允贤却称不要任何赏赐，而只想去北五所见郕王一面，玉香在旁边咳嗽提醒，允贤欲言又止。皇后来给太后请安，又受到太后一顿训斥，允贤以递茶为由打断太后训斥，将太后的火气转移到自己身上，又“耍宝”化解了太后的怒气。
太后眼疾发作，允贤假称可以将太后眼上的疾病转移到脚上，并让太后蒙眼数日，同时劝太后放宽心不要过于操心朝政。几日后，太后的眼疾固然除去，脚上也并无毛病。因允贤用“祝由之术”为太后医好眼疾甚得太后欢心，太医院沸然，程十三首先言语抨击允贤，村霞及众太医亦附和，而刘平安则挺身为允贤辩白，劝众太医承认自己技不如人。钱皇后劝太后好好休养身子，不要过度操劳朝政，且以当年太皇太后压制太后作比，劝太后看到皇上已经成年，放手朝政让皇上诸事都能亲力亲为。太后听了钱皇后的一番劝解加之一病想通了许多事情，决定与皇上重修母子情分，还政于皇上，退居后宫颐养天年，但仍与皇上“约法三章”。允贤拿着药方去太医院取药，药方上却无端多了一味“朱砂”，犯了国讳，因而被御药房的侯太监借故重罚。眼见允贤受罚，太后又去了青羊观还愿，玉香急忙去找皇后帮忙，却在路上撞见了皇上，皇上听说了允贤的名姓，立马去一看究竟，并与允贤相认将允贤救走。
皇上将允贤从御药房救出，允贤这才知道原来自己之前交的那个好朋友“郑齐”竟是当今皇上。皇后担心皇上将允贤纳入宫中，继而坏了皇上与祁钰的兄弟情分，自作主张派人将允贤还活着的消息通知祁钰，祁钰得知心爱之人历劫生还，立即恢复了精神，健步如飞赶到殿上与允贤相见，二人久别重逢深情相拥，雨中互诉衷肠。皇上早知二人两情相悦，于是召来祁钰的母亲吴太妃，打算给祁钰赐婚，吴太妃以为皇上是要给祁钰和安和君主汪美麟赐婚，喜出望外，连连答应，可见了允贤，吴太妃才明白过来原来皇上这是要给祁钰和允贤赐婚，坚决拒绝，称允贤曾上过公堂，有失清誉，且曾抛头露面给男人诊病，有违妇德，故宁愿抗旨也绝不让允贤成为自己的儿媳。
吴太妃因赐婚的事情在殿上晕倒，允贤当即为吴太妃把脉发现太妃的身子并无大碍根本就是假装晕倒，但允贤并未戳破吴太妃的把戏。吴太妃回到住所，太医刘平安为其诊病亦觉得吴太妃身子并无什么毛病，可就在这时，太后却带着程十三来给吴太妃看病，吴太妃给程十三使眼色，程十三则支开众人借诊病之名，行给太妃出主意之实。太后斥责祁钰“见色忘孝，是为大耻”，祁钰因此而心生愧疚。祁钰听了太妃的贴身太监的建议，想让允贤改名换姓，以此掩饰允贤真实身份，改名换姓原是耻辱之事，可允贤为了不让祁钰为难，勉强答应，祁钰也向允贤保证以后再不会让允贤受一点委屈。允贤求见皇上，虽说了自己或将改名换姓的事情，却并非要为自己叫屈，而是借此说出杭家多年前的那桩旧案，并请求皇上彻查此事，找出真凶，为杭家平反冤情，恢复她谭家旧姓。
祁钰带允贤正式拜见母亲，吴太妃表面答应重新看待允贤，见了允贤却又对允贤横加侮辱，说她清白有辱，不守妇德，还禁止允贤以后再研习医术，行医治病，允贤满腹委屈，忍无可忍，说太妃若是看不惯她习医行医，她也不会勉强嫁入郕王府，说完转身离去。祁钰埋怨允贤在母亲面前态度强硬，还表明虽同意允贤继续研习医术，但不愿意允贤以后再出去给人治病，允贤质问祁钰是否忘了当初在绣楼对她说过的话，许下的承诺——支持她的医学梦想。