菊香再次醒来，发现自己被冲到海边，她四处寻找月娘，最后在海滩上发现了已经奄奄一息的月娘，菊香伤心地痛不欲生，月娘终于苏醒过来，菊香又惊又喜。山本洋介正在照相馆焚烧资料的时候，突然听到月娘喊他爸爸，他转身看到菊香和月娘又回来了，情不自禁紧紧拥抱她们母女俩。
1942年2月15日，农历新年当日，驻新加坡英军向日军投降，三天后，日军开始展开屠杀华人的行动，在日军的大检证中，数以万计的华人被残杀，市面一片恐慌，人人自危。山本洋介躲过日军的追杀，被石燕子救到安全地带，石燕子受陈盛之托保护他们，让他们等日军走后赶快离开市中心。
山本洋介带着菊香和月娘到郊外的一处房子安顿下来，发誓一家三口永远在一起，再也不分开。月娘一早醒来饿得肚子咕咕叫，就起来给爸爸妈妈做饭吃，不料有几个日军突然闯进来，山本洋介赶忙用大箱子把门堵住，想掩护菊香和月娘逃走，日军撞开门，让菊香和月娘出来，山本洋介假扮成当体土著峇峇，吓得连连求饶，月娘说明父母是峇峇和娘惹，日军小队长早就听说娘惹煮的菜一级棒，就逼菊香给他们煮菜。
菊香精心准备了娘惹菜，日军小队长大快朵颐，对菊香的手艺赞不绝口，山本洋介趁机想带着菊香和月娘溜走，被日军拦住，他给山本洋介盖章通过检证，让菊香洗干净来伺候他，菊香只能硬着头皮照办，日军小队长把山本洋介和月娘赶出去，他想强奸菊香，菊香拼命反抗，和他大打出手。
月娘拿出一把辣椒交给山本洋介，求他去救菊香，山本洋介把日军一一打死，把菊香救出来，菊香被日军打得口吐鲜血，日军一个小队听到枪声赶来，山本洋介情急之下换上日军军服，把那一队日军引到相反的方向。山本洋介刚想带着菊香和月娘逃走，远远看到日军在枪杀当地土著，他吓得赶忙带菊香母女俩从树林里逃走。
山本洋介听说木村现在是商会会长，想去找他求助，远远看到查理张从里面出来，就让菊香带着月娘先走，查理张认出山本洋介，立刻向日军长官举报他就是通缉的逃兵山本洋介，山本洋介掩护菊香和月娘离开，他被一枪击毙。
菊香和月娘远远看到山本洋介被枪杀，她们俩伤心地痛不欲生，菊香急火攻心再次吐血，她跌倒在地上，还是挣扎着起来拿出娘惹盖盅里的地址，让月娘按照地址去找马六甲外婆，说完这些话，菊香就倒地不起，永远地闭上了双眼。
月娘一夜之间就成了孤儿，她把母亲埋葬，就跟着难民一起流亡，四处打听怎么去马六甲，终于遇到一辆去马六甲的货车，月娘一路颠簸来到马六甲。
由于战争原因，马六甲的大部分居民也都去逃难，阿桃和天兰守在黄家，大傻饿得满大街吆喝，阿桃听不下去，拿着扫帚出来打大傻，突然看到一个衣衫褴褛的小女孩站在门外，手里紧紧攥着一张纸条，阿桃赶忙把天兰叫出来，天兰恍惚以为菊香站在眼前，抱着她嚎啕大哭。
阿桃一再提醒天兰，她不是菊香，月娘当场跪地给天兰磕头，说明她是菊香和山本洋介的女儿，阿桃担心天兰接受不了菊香和山本洋介的死讯，谎称他们俩躲到很远的地方，天兰信以为真，抱着月娘喜极而泣。
从那天开始，天兰让阿桃教月娘舂香料，月娘天资聪明，很快就掌握了其中的奥秘，天兰教她珠绣，月娘不停地扎手，天兰让她用心来绣，就不会出错，月娘偷偷到各个房间参观，在里面乱翻一通，还在小姐的床上又蹦又跳，阿桃跟在后面收拾，提醒她不要随便进小姐的房间，天兰为此教训了月娘一顿，月娘不由地想起了母亲菊香，天兰对她好言相劝，反复提醒她是大户人家的娘惹，做事要有教养，否则将来就嫁不出去了，月娘都一一记在心里。
转眼十年过去了，月娘已经长成亭亭玉立的大姑娘，她深得天兰真传，做的一手最棒的辣椒酱和过硬的娘惹菜，阿桃无意中透露了菊香和山本洋介的死讯，天兰因为伤心过度一病不起，她们的日子越发过得捉襟见肘，天兰不许阿桃变卖黄家的任何东西，月娘就做了辣椒酱和娘惹糕到街上卖维持生计，很快吸引了很多来往的客人，阿桃在一旁帮忙，月娘看到大傻被欺负，就主动拿出娘惹糕给他吃，有两个小混混趁机来捣乱，月娘就塞给他们满嘴的辣椒酱，两个小混混被辣得狼狈逃窜。
月娘用卖娘惹糕的钱给天兰买药，天兰看到楚楚动人的月娘，觉得她和菊香长得越来越像，月娘劝她去医院治疗，天兰坚决不答应。当天夜里，那两个小混混偷偷来到月娘和阿桃住的后院，想对她们图谋不轨，多亏月娘事先做了精心的准备，用绊马索把他们绊倒，地上还破满了碎瓦片，小混混们被扎的满脸是血，灰溜溜逃走了。
阿桃带着月娘一起干活，一边给她讲菊香的事，家里的电话突然响起来，阿桃吓得不知所措，她赶忙接起来，才知道黄元要带着全家老小回来了。
黄元夫妇带着黄金诚一家妻儿老小从英国回到新加坡，儿子黄天宝带着妹妹黄玉珠和黄珍珠先下船，他们不舍得离开英国，都不愿意回到马六甲，忍不住大发牢骚，他们远远看到查理张来码头接儿子罗伯张，黄天宝和黄珍珠一起过来打招呼，还主动把马六甲的地址交给罗伯张，黄金诚和秀凤拎着行李箱出来，一眼就认出查理张，黄金诚赶忙跑过去问候，查理张很不耐烦，借口有事赶忙离开了。
月娘和阿桃把家里里里外外收拾得干干净净，阿桃手忙脚乱，不小心差点摔倒，月娘很心疼，赌气不再伺候那些人，阿桃无意中透露了天兰和菊香被黄家人欺负的事，月娘都一一记在心里，天兰拖着病体挣扎着起来迎接黄家老小，月娘精心给她梳了发髻，还特意打了腮红，人一下子精神好多，月娘想多学点本事，将来就不会任人宰割。
黄元带着一家老小回家，月娘搀着天兰出来迎接他们，桂花顿时惊得目瞪口呆，恍惚间觉得菊香在眼前，月娘认出桂花是把她扔进大海的狠毒女人，假装不动声色看着桂花，自我介绍是菊香的女儿，桂花不承认，天兰连连解释，阿桃还向黄元汇报了了家里的仆人因为拿不到工钱全走了，日军和地痞流氓时常来敲诈勒索，多亏月娘做娘惹糕去卖维持生计，黄金诚声称定时寄钱回家，可天兰一分钱也没有收到过，桂花诬陷她把钱乱花了，天兰矢口否认，黄元很不耐烦，急忙打断她们的争执，带着妻儿老小给祖先上香。
阿桃一瘸一拐把行李分别送到每个人的房间，帮他们一一整理好，黄天宝看到房间里有很多小时候的衣服，一气之下全部扔了出去，黄珍珠逼阿桃帮她收拾行李，黄玉珠心疼阿桃辛苦，就主动帮黄珍珠收拾。桂花在黄元面前说了天兰很多坏话，想尽快把月娘赶走，借口她来路不明，黄元不胜其扰，不想听她继续啰嗦，桂花不依不饶，黄元坚持让月娘留下来，他清楚地记得当年曾经答应过天兰要收留菊香。
黄元因为旅途劳顿病倒了，桂花趁机处处刁难天兰，月娘看不惯，就向桂花建议雇几个人帮工，桂花坚决不同意，黄金诚口口声声称菊香逃婚嫁给山本洋介丢尽了黄家的脸面，山本洋介还从英军窃取情报，让马六甲和新加坡遭受战争的灾难，月娘极力为父亲山本洋介辩解，一口咬定父亲是被日军打死的，黄金诚反复讲明菊香和黄家没有任何关系，想把月娘赶走。
天兰跪下恳求桂花，桂花最后决定留下月娘，只能当佣人，而且不给工钱，天兰只能硬着头皮答应下来，还劝月娘认命，等过两年找个好人嫁了就彻底解脱了，月娘不甘心这样委曲求全过一辈子。
陈盛回到马六甲，四处打听石燕子的下落，结果杳无音信，陈盛不由地想起菊香和月娘，伤心地捶胸顿足。陈盛醉醺醺回家，大声叫喊着要找警察抓黄美玉这个杀人凶手，黄美玉借口陈老太太刚睡下苦苦规劝他，陈锡闻讯赶来，把陈盛搀走了。
桃姐来给桂花倒痰盂里屎和尿，桂花坚持让月娘帮她倒，月娘只好硬着头皮进来，还被桂花无缘无故骂了一顿，月娘只好服侍桂花穿上拖鞋，然后端着痰盂出门，迎面碰上黄珍珠，黄珍珠逼她把自己房间里蚊子全部打死，否则就对月娘不客气，黄天宝在房间里打球，直接把球扔在月娘手里的痰盂里，里面的屎和尿溅了黄珍珠一身，她恼羞成怒，狠狠打了月娘一耳光，黄玉珠赶忙过来解围。