挖开的棺材里空无一物，令巨子情绪失控，不论小植如何劝阻，他都坚持要去找下落不明的女儿。蓉儿逼不得已，只得将当年碧华去世的原因讲了出来。
碧华原是上古大巫羲仲的后代，是羲氏一族的圣女。本该终身不嫁的她却为了鞠玄（巨子）背叛了族人，私自到了燕国。刺秦失败，鞠玄逃入墨家后，先代巨子命蓉儿暗中照顾碧华母女。不久之后，大司命找到了碧华，要将她带给东皇太一发落。碧华以女儿重病为由，求得了几天时间，将女儿托付蓉儿，并为女儿改名高月。
蓉儿见碧华神情焦急，又担心月儿身体不适，询问之下，得知月儿继承了碧华的血脉，是坤元玉珪。坤元玉珪的秘密事关義氏一族的命运，若被族人知道，月儿将会有灭顶之灾。蓉儿带着月儿连夜离开，碧华建起一座空坟，对外宣称女儿病死。明知回到羲氏一族必死无疑，但为保护女儿，碧华仍无怨无悔。巨子理解到碧华的良苦用心，答应蓉儿带走月儿，让她远离过去的纷扰。
蓉儿再三请求巨子与月儿相认，用月儿的血缓解毒素。巨子不同意，身为父亲，他不想让月儿承受两次丧父之痛，更不想辜负碧华的苦心。巨子说已经找到了真正的贤能之人，只要尽力辅佐他统一天下，造福百姓，自己就算是做完了该做的事情，可以撒手离开了。在巨子的请求下，蓉儿答应向月儿保守秘密，却被躲在竹林里的天明听到了他们的谈话。
心事重重的天明找到了正在包药的月儿，被月儿的玩笑话一激，将巨子就是她亲爹的事情失口说了出来。月儿激动之下甩开天明，去找蓉儿和巨子想要问个明白。 得知巨子已经去往咸阳，月儿试探蓉儿，谎称曾梦到巨子就是自己的亲爹。见蓉儿言语躲闪，月儿决定下次亲自问巨子。
墨家机关城是经过几代弟子的努力，将一整座山掏空，以山中流水作为动力，四处布满机关和守卫的神秘所在，寻常人连入口都找不到。
蓉儿和班大师带大家进入机关城，众人对机关城的精密和机巧表示赞叹。盖聂等人乘坐机关梯来到了日月甬道。班大师叮嘱只能走刻着日轮的石板，否则触动机关万箭穿心，盖聂叮嘱天明跟紧班大师。天明不听话，随意踏出一步，触动了机关，被盖聂救下。
蓉儿集结墨家高手，安排为天明治疗。天明觉得大家对自己好，都是因为父亲的面子，并非真心，于是把自己关在屋里闹情绪。
少羽找到天明，要带他和月儿一起闯禁地玩，月儿想拦住两人，却忽然听到了儿时听过的曲子。少羽发现并扳动机关，一扇门打开，三人刚走进去，就被班大师的机关笼子关住。之前少羽听说墨家要辅佐贤能统一天下，以为自己就是那个贤能之人，怕这次闯祸影响自己在墨家的形象，于是在班大师训斥三人的时候，撒谎说是天明出的主意。
天明为少羽承担了责任，被班大师和蓉儿锁在屋子里面壁思过。
巨子在咸阳没有见到扶苏，回到机关城。见城中弟子士气低落，于是让小植安排竞技大会，重振士气。
月儿和少羽被罚扫院子，好不容易完工后月儿去找巨子，却被守卫拦在门外。
少羽找天明道歉，心里委屈的天明在屋内乱扔东西撒气。盖聂和蓉儿赶到，怕天明情绪激动影响治疗，于是踢开门打晕了他。盖聂怕蓉儿总是这样束缚天明，会使他越来越逆反，心病加重。蓉儿见盖聂不理解自己的苦心，一气之下将他赶出了门。
竞技大会在巨子的主持下如期举行，天明也被允许在月儿的监管下看比赛。为了鼓舞大家的士气，巨子起身鼓掌，表现的非常高兴。蓉儿担心巨子的身体，几次探手把脉，都被巨子挡开。拗不过巨子，蓉儿只得将早已准备好的药递了过去。由于不能上场，天明百无聊赖的站在月儿旁边看别人比试。
比武场上，武功高强的韩信击败了所有对手，少羽被情绪高涨的墨家弟子推举进场，与韩信一争高下。
少羽惯使枪，韩信善用剑。几回合下来，韩信手中的剑被少羽击飞，少羽乘胜追击，单手用枪挑起了一块练功用的巨石直指韩信。韩信败下阵来，却挑起了同样以力量见长的锤哥（樊哙）的兴趣。锤哥将少羽枪上的巨石甩飞出去，又唤十几个墨家弟子抬上来一口重达两千五百斤的巨鼎，要跟少羽比力气。
锤哥用两只手举起的重鼎，却被少羽轻松托起，并单手抛接了几次。见大家都在称赞少羽天生神力，被月儿冷落一旁的天明嘲笑少羽只有一膀子傻力气，没什么了不起的。
大会上，盖聂一直在关注着天明，见他和月儿离开赛场，便找到天明，想跟他说出真相。天明一直被另一边的爬杆比赛吸引，见盖聂一副吞吞吐吐的样子，借口去茅房，却跑到了比武场上。
从小就擅长爬高的天明，几下就攀到了杆子上端。为了显摆自己游刃有余，又在杆子上表演出各种高难度动作，引得蓉儿和巨子都很担心。最终，天明被盖聂用石子击中，掉下杆子。
得知天明是因为盖聂的疏忽，才跑去爬杆子，蓉儿将盖聂拉到一边。盖聂想解释，蓉儿不听，还给他一个耳光。蓉儿一怒之下，说自己只想治好天明，至于盖聂，她根本不在乎，并且警告盖聂不要再去招惹天明。
一直被父亲光环笼罩的天明，非常想得到大家的关注和认可。在竞技大会散场后，天明独自爬到了杆子的顶端，幻想下面有月儿和墨家弟子为自己鼓掌叫好。天明的幻想被盖聂的到来打断，而盖聂也终于将自己亲手杀掉荆轲的事情说了出来。盖聂告诉天明，自己不愿收他为徒的真正原因，也是希望将来天明能够没有负担的找自己报仇。
天明一直都很感激盖聂的救命之恩，得知盖聂以为自己会找他报仇，天明感到伤心和失望，一气之下告诉盖聂自己会亲手杀了他。回到屋子，天明将盖聂给自己画的剑谱撕得粉碎。怒气消去，看着一地碎片，天明心中不忍，于是又一片一片的拾了起来。
蓉儿和一个弟子在屋里找人参续命丸给巨子，被门外的月儿听见。得知巨子有危险，月儿跑去找巨子。
在去给巨子看病的路上，蓉儿被盖聂拦住。得知盖聂已经把真相告诉给天明，蓉儿对盖聂更加的生气。
月儿来到巨子屋内，谎称自己替蓉儿来给他检查身体，巨子赶紧将手藏入衣袖，掩盖中毒的迹象。月儿想问巨子是不是自己的父亲，却被赶来的蓉儿打断。恰好此时有弟子报告找到了扶苏，为了阻止月儿再问，巨子决定立刻出发去见扶苏。月儿告诉巨子，自己会等他回来给出答案。
剿灭金氏商社却没有抓到巨子等人，令秦王龙颜大怒。胆小的胡亥怕嬴政杀了自己，承诺要带兵攻破机关城，手刃巨子。
胡亥哭着寻求赵高帮助自己找到墨家机关城，赵高见胡亥已经完全被自己掌控住，心中窃喜，答应帮他解决问题。
卫庄来找赵高归还定金，称已与盖聂恩怨两清，不再参与其中。赵高邀请卫庄再跟自己合作，破掉机关城。被拒绝后，赵高施法困住卫庄，希望能与他好好谈一谈。
赵高告诉卫庄，他辅佐的公子胡亥是个容易被控制的蠢货，他的理想是踩着胡亥夺得天下。赵高许诺得到天下后，会助卫庄重振七杀门。卫庄被说动，提出两个条件，其一盖聂只能由自己处置；其二胡亥手下的官兵听令自己任意调遣。赵高欣然答应，二人成交。
雪女去找班大师，求他帮忙修理高渐离弄坏的筑。班大师打开筑，发现一根羽毛（白凤所藏），随手扔掉后，被白凤的鸟儿衔走。
墨家机关，木石走路；青铜开口，要问公输。公输家与墨家世代为仇，公输仇是机关方面罕见的奇才，从小立誓要彻底击败墨家。卫庄拜会机关大师公输仇，以胡亥的大军为筹码，邀请公输仇加入，一起攻破墨家机关城。
公输仇早年隐姓埋名拜入墨家，对机关城内部结构了如指掌，但每次出入都被蒙着双眼，所以不知具体位置。公输仇答应卫庄，只要他找到位置，自己便可以将其攻破。
赤练推测白凤当初偷藏在小高身上的羽符已经被带入了机关城，让白凤带着去找机关城。白凤与卫庄不合，不愿说出机关城位置。赤练说只要能找到机关城，自己就算死也值了，白凤无奈，只得说出机关城在云梦泽以北的山里。
卫庄练功，白凤以羽符偷袭不成反被伤。卫庄告诉白凤，他引以为傲的速度，在自己眼里根本不算什么，要想打败自己，还差得远。
雪女将修好的筑交还给小高，小高故意弹走音，将躲藏起来的雪女引出来，并邀请她共同合奏了曾经的那首曲子。
白凤基本确定了机关城的方位，卫庄派大量秦兵搜山。小植向班大师汇报情况，说到机关城外围的机关都被破掉的时候，班大师不小心将杯子掉落在地上。同样的情景，使他想到了公输仇。公输仇在企图偷走墨家秘宝的时候，被废掉了左手。
官兵已到机关城门口，锤哥派人前去，班大师叮嘱弟子出城莫要恋战。
赤练告诉卫庄一小队墨家弟子已经出现。卫庄笑称好戏要开始了。机关城里众人紧张，派出的弟子已经三个时辰仍未归来。正在给天明传功的锤哥听到弟子的汇报，急着去救兄弟，留下了身体虚弱的天明。班大师等人得知锤哥擅自出城，半个时辰仍未归。小植怀疑是圈套，要去救大锤，被班大师安抚住。
盖聂担心传功中断会使天明陷入危险，跟蓉儿一起跑去看天明。推开门，见天明内力混乱几近崩溃。盖聂要为天明传功，天明因为赌气拒不接受。盛怒之下，盖聂训斥了天明的种种任性行为，天明自觉理亏，为了不再给大家添麻烦，接受了盖聂的传功。
锤哥找到被袭的墨家弟子，却被蛊娘操纵蛊虫围住。墨家弟子不敌蛊娘，锤哥派人报信回机关城。