刘铭传觉得杨得标为可用之才，让他戴罪立功——把大炮从山腰移到山顶，以便提高大炮的射程，杨得标满口答应。 法军妄图劝降孙开华，孙开华则利用机会提前做好防御部署。正在法军提前庆祝战争胜利之时，孙、刘齐心合力，向法军展开进攻，击伤了法国远东舰队副司令官利士比将军的军旗坐舰，旗开得胜。经此一役，刘孙二人尽释前嫌。法国得知战败消息向清国提交“哀的美顿书”：七十二小时内，清国如不给答复，就意味着两国提前进入战争状态。 张佩纶视察马尾港，发现法军战舰也停留在港内，与福建水师近在咫尺，甚为堪忧，立即给李鸿章发电报。李鸿章却坚持认为中法交涉尚存一线生机，不可自生事端，要张佩纶按兵不动。 眼看中法之战一触即发，为掌握主动，水师各船的兵勇向张佩纶求战。此事传至北京，两宫皇太后颁懿旨：朝廷仁至义尽，衅不我开。

法军企图全歼福建水师，张佩纶决定沉船堵江口，秘密要求停泊在马尾的各中立国船只迅速退至公海，各国均不配合，马尾海军失去了抵御法军舰队进攻的最好时机。 在台湾基隆，刘孙二人为防止法军舰队登陆，沉船封海路，怎料，此决定影响了渔民们的生计，他们聚集在营门口，纷纷抗议。刘铭传向大家解释，正左右为难之际，商人林维源用自己的二十万两白银为其解围，并请众人帮刘铭传修炮台、挖战壕，共同抵御外敌。 清光绪十年，即1884年8月23日。在清军毫无防备之时，法国远征舰队率先开炮，福建水师半小时内全军覆没。马尾造船厂全部倾覆，大清海军的摇篮毁于一旦。张佩纶上书自劾，并参相关官员玩忽职守，但翁同和却证实张佩纶所奏与事实大相径庭，张佩纶被革职。 左宗棠领旨赴闽督办福建军务，西太后叮嘱他着力支持刘铭传。与此同时，两广总督张之洞详读唐景崧所写的《请缨日记》，深感唐景崧为可塑之才，让他送军备粮草给刘永福的黑旗军，以实现其承诺。

赴越之前，张之洞建议唐景崧自建景字营，留守越南，并慷慨承担所需的军备粮草。 刘铭传亲侄刘朝宗加入基隆的海防前线，令提督曹志忠深受鼓舞，誓与炮台共存亡。台湾在籍员外郎林朝栋募集义勇五百名，自带衣食、武器，以求赶赴基隆，为保台尽力。 远东舰队司令官孤拔率领舰队。强攻基隆，敌我相差悬殊。审时度势，刘铭传下令放弃基隆，炸毁基隆煤矿，以狮球岭为界，退守沪尾，力保台北。此决定令上下官兵，义军义士皆为震惊，秀才丘逢甲联名上书，告刘铭传的御状。此时，只有孙开华明白，刘铭传的决定乃是保台良策。 一切如刘铭传所预计，法军虽然占领了隆基，但清军与民众共同坚守狮球岭，令法军损兵折将，登陆士兵无一生还。沪尾大捷，全岛振奋。孤拔不敢再犯沪尾，下令无限期封锁台湾。 消息传到北京，朝廷一片哗然，众人都误解刘铭传“怯敌”，临阵脱逃，众臣纷纷上书弹劾。李鸿章却上奏保刘铭传，西太后下旨将刘铭传革职留任。