二十八军东渡黄河到山西打通抗日道路，同年四月十四日，在与敌人的战斗中，刘志丹不断靠前指挥，侦察敌情，不幸中弹牺牲，年仅三十三岁。习仲勋得知消息后策马东驰，站在山顶看着刘志丹装殓在一口薄棺中，被军民抬回了保安，心中悲痛万分。同年六月，中共中央决定将保安县更名为志丹县，毛泽东题词赞誉刘志丹是“群众领袖，民族英雄”。

毛泽东在了解有关习仲勋等人的情况，获悉他们当年被扣右倾帽子，含冤入狱，不禁感慨陕甘根据地让党中央和红军有了落脚点，全都是这些干部的功劳，可惜刘志丹和谢子长牺牲，很多同志受过太多委屈，他们都是优秀人才，绝对不能大材小用。

一九三六年九月，习仲勋被毛泽东选中破例参加会议，并与毛泽东见了面。如今国民党调动了十一个师的兵力，疯狂“围剿”关中苏区，习仲勋被中央派往旬邑，担任关中特委书记，途中遭土匪包围，马老三听到习仲勋会说黑话，对他也早有耳闻，果断交了他这个朋友，爽快放行。

等到了旬邑以后，习仲勋召集大家开会说下目前情况。秦木兰表示敌人施行家家连坐的保甲制度，以瓦解他们的党组织和游击队，以至于很多同志都隐蔽起来，武器枪支就地掩埋，所以关中整体状况就是要人没人，要枪没枪，陷入一种尴尬的境地。

然而习仲勋认为很多同志隐蔽起来，说明没有投敌并信任党组织，当务之急就是要尽快联系各地的党员，而且要动员所有同志拿起枪恢复组织，与敌人开展斗争。除此之外，习仲勋劝降一些反动民团，化敌为友，几个月时间就打开了局面。

同年十二月十二日，张学良、杨虎城在西安发动兵谏扣留蒋介石，中共中央派周恩来等前往西安促成了西安事变的和平解决。也正因如此，这件事成为时局转换的枢纽，十年内战的局面基本结束，国内和平初步实现，国共两党实行第二次合作，共同抗日。

随后习仲勋去见了彭德怀，得知八路军准备东渡黄河，而他要在一个月内征集三百人的预备营，补充到贺龙的一二零师。可问题是关中苏区大部分都属于山区，本地兵源实在太少，郭炳坤跑断了腿也只招募到三十人，并且这三十人里良莠不齐，身体素质不好。

此时李三娃主动来找习仲勋，表示自己要当兵打鬼子，但习仲勋认为他年纪太小，安排郭炳坤把他送回去，告诉他好好学习知识文化，以后有的是机会贡献。听了习仲勋的话，李三娃不再坚持。最终在习仲勋的不懈努力，总算从关中招满了人，甚至还补充了一个团的人数，令贺龙非常高兴，把自己最喜欢的手枪送给他。

一九三七年八月，中共中央革命军事委员会发布红军主力，改编为国民革命军第八路军的命令。八路军各部于八月至十月间，分别从泾阳和富平等地出发，东渡黄河，开赴抗战前线。习仲勋回到富平，先是去曾经的学校看了一眼，又来到家里，见到了二妹习东英、小妹习雁英以及三叔习宗仁。