小智一行人在旅行途中的荒野，遇见了寻求帮助的受伤的跳跳猪，跳跳猪们原本在荒野中的绿洲和平的生活着，但是噗噗猪的出现，使得跳跳猪们都被欺负，只有自己逃了出去，小智一行人决定帮助跳跳猪，最后被幕后黑手火箭队所设置的笼子关了起来。从牢笼中溜出去的咚咚鼠和黏黏宝与噗噗猪进行对战！这时黏黏宝的样子！？

旅行的途中，路过卡洛斯发电站的附近的小智一行往发电站走去。然而接近发电站的皮卡丘们发生异常！其实火箭团占领发电所操纵电系神奇宝贝！小智的神奇宝贝们们帮助发电站的人员？说起来希特隆有什么烦恼的样子……？

与小智一行的战斗，小次郎喵喵和走散了的武藏果然翁。掉到河里被医生的救了。于是武藏和医生一见钟情！…在爱与恶的中间苦恼的武藏，火箭队变成怎样！？