因为小精灵泡芙的关系莎莉娜和米露菲产生了矛盾，为了一较高下，两人都参加了小精灵泡芙比赛。而当比赛接近末尾时，作为材料的树果全都不翼而飞了。为了寻找树果，小智一行人来到了森林中，但那里的树果也全都被人偷走了。正当奶油球指示大家树果方向时，远处的莎莉娜发出了尖叫，原来是森林中的绵绵泡芙因缺少甜食变得非常暴躁。

小智和同伴们在前往第三个道馆所在的娑罗市的路上。然而，他们在途中遇到的花蓓蓓却一直黏在柚丽嘉的花型头饰上面不肯离开，它本应随身携带的妖精之花也不见了踪影。来到城市后小智他们遇到了花蓓蓓的训练家灰，灰和韩娜这对老夫妻和花蓓蓓一直生活在一起，在探望重病韩娜时花蓓蓓弄丢了自己的花，知道情况的小智等人决定帮助花蓓蓓找回妖精之花。

在小精灵表演赛中小智目睹了卡洛斯地区冠军卡露乃的风采，她和小精灵沙奈朵有着很深的羁绊，而博士也为了调查超进化调查上了卡露乃。后因为热销的巧克力 蛋糕的缘故卡露乃接下了小智的挑战，在小智和卡露乃决战的过程中火箭队又从中作梗，通过心灵的呼唤卡露乃找到了被抓走的沙奈朵，超进化后的沙奈朵发 挥出了强大的力量。