尤金和爱信逃到了美国大使馆，浪人们被美国人射杀了一批后，他们很快就撤退。凯尔及时赶过来认出了尤金，但尤金和爱信被关起来了，因为尤金向美国公使馆开枪。面对现在的处境，尤金和爱信心里都有点自责。他们虽然被关，但在这里是安全的，爱信靠在尤金的肩膀上渐渐睡去。
第二天尤金承担下所有责任，他被带到军事法庭，爱信被凯尔偷偷带出。凯尔特地写信为尤金说情，所以尤金只被判了三年监禁。而爱信虽然逃出了公使馆，但逃出日本很是困难，因为浪人们已经在港口一直搜捕。为此爱信赶紧让人给朝鲜发电报，阳花和熙星都收到了。虽然电报内容很隐晦，但是阳花猜出了爱信的处境，她马上给皇帝打电话求助。皇帝立刻命令李完用带领使团出访日本，作为对伊藤博文访问朝鲜的回礼，他让爱信就随着使团回来。为了给爱信传递消息，熙星特地联系了自己在日本的女人，让她与东魅汇合，然后给爱信传递消息。为了引开港口的浪人们，东魅单枪匹马出现在海滩上。所有浪人立刻围了过来，东魅杀人都杀到筋疲力尽。当武臣馆首领出现时，东魅还不打算罢手，首领一刀砍去，东魅葬身大海。
爱信顺利回到朝鲜，皇帝也让人将爱信的枪带了回来，算是对她这次行动的嘉奖。爱信还特地去感谢阳花和熙星，但阳花这次救她其实是为自己，因为自己的父亲害死了爱信一家，这次她就当是赎罪了。房大伯和咸大婶也在外国人的墓地等待爱信，看着她平安归来，他们很是开心。
但使团中有密使这件事情却被伊藤博文大做文章。朝堂上亲日派的大臣们也以此为借口想让皇帝自杀谢罪，如果不想自杀，那就让出皇位给太子。这时候的朝鲜已经差不多被日本掌控，那些大臣们看见皇帝不服软，甚至在朝堂之上就拿出了枪对着皇帝，紧接着又进来一群日本兵。虽然张猎户挡在前面，但仅凭他一人之力也无法阻止日本军队。皇帝最终妥协同意退位，但是他不准任何人动张猎户。
三年后，日本对朝鲜的侵略更加严重，他们霸占了阳花宾馆的二楼做了宿舍，还将宾馆上的朝鲜国旗换成了日本国旗。在东京，日本人还将俘虏来的朝鲜人当做动物供人参观。日本人控制住新皇帝后，竟然让皇帝发布诏令解散军队。日本人给了那些军人一些钱，并且还威胁到要是敢反抗就会被就地枪决。但是侍卫队的大队长朴承焕却不想这样跪在日本人面前，他在自己的办公室里面对着朝鲜的国旗自杀了。这一枪让俊赫想起当初尤金说的话，他立刻让队友停止交还武器。朝鲜的士兵们终于有了反抗和逃跑的意识，他们开始抢夺日本的枪和子弹。可是日本有重型武器，这些年轻的士兵们只能以死相搏。俊赫的一个朋友也受了伤，眼看就要全军覆没，张猎户及时赶到，跟俊赫一起掩护他们离开。但张猎户却也被枪打中，他忍着伤痛，将最后的炸弹点燃，与赶来的日本兵同归于尽。逃到大街上的朝鲜兵一直在被日本兵屠杀，这样的情景朝鲜的民众也看不下去过来反抗，阳花也在电车上不做任何遮掩地开枪。俊赫带着伙伴们逃到了黄恩师那里，黄恩师他们听说张猎户牺牲了，感觉悲痛万分。
尤金出狱之后见了凯尔和约瑟夫教堂的神父，他便出发回朝鲜。但没想到回来后竟然看见的是尸横遍野。尤金一抬头，东魅也站在面前。东魅没那么容易死，他一直在满洲鸦片馆里养伤。两人寒暄一阵后突然听到宾馆方向有枪声，当两人跑到宾馆前，宾馆突然发生了爆炸。这场爆炸是阳花和爱信策划的，趁着日本人喝酒庆功，阳花将他们灌醉，爱信趁机安放炸弹。这些日本兵们没有一丝警觉，都已经葬身火海。
熙星的报社一直在揭露着日本人的真面目，当民众看见日本人如此对待朝鲜人后都十分的愤怒。除此之外，熙星还被一个女人缠上。这个女人是个小裁缝，虽然身份不是贵族，但却长相出众，一眼就被金夫人相中，而且她还是俊赫的姐姐。小裁缝直接跑到当铺要老板伪造她和熙星的婚书，但是她并不是喜欢熙星，而是担心俊赫没了担保人会被退学。熙星本来就不想结婚，这个女人竟然还不是因为爱而想跟自己结婚，熙星就更加愤怒了。但小裁缝也没就此放弃，她一直在熙星身边。借此，熙星也终于体会到爱信对他的心情。
尤金虽然不想承认自己的祖国是朝鲜，但他却对朝鲜有着期望。他这次回来就是要跟爱信、跟义兵们一起战斗拯救朝鲜。
在宾馆爆炸之前，阳花安排好了其他的人员，可是当她和爱信要离开的时候，日本人突然有所察觉。当炸弹引爆，阳花和爱信都没来得及跑远，两人身负重伤。这时，尤金和东魅已经赶到，东魅带着阳花先走，尤金在现场寻找爱信。
阳花伤的很重，东魅背着她离开，在裁缝铺里待了一晚。阳花挣扎着醒过来，她求东魅带她去母亲的墓前。东魅一路都背着她，阳花也觉得自己时间不多了。她趴在东魅的背上终于跟他吐露心声，在东魅消失的这段时间里，阳花每天都在盼望着他能够平安回来。可是说着说着，阳花就渐渐地闭上了眼睛。东魅一直以为自己爱的是爱信，可当与阳花生离死别，东魅终于知道自己的真心。
尤金在宾馆院里找了半天才找到爱信，爱信伤的也是很重。尤金在黄包车夫的帮助下带着爱信离开，半路上遇见了义兵，他们找了个房子安置爱信。之后尤金冒险去医院拿药品，医院的护士帮尤金掩护。可这个时候日本兵突然冲进来要安置病人，他们还把病床上的朝鲜兵一枪打死。看到这样的情景，尤金再也忍不住，他走出来几下就把日本兵放倒，然后带着一名幸存的朝鲜兵离开。
回来之后，尤金给爱信做手术，爱信也脱离了生命危险，跟随义兵到达了安全的地方。晚上，东魅和尤金汇合，相互说了一下对方的情况。听到阳花去世的消息，尤金感觉非常惋惜。这时候东魅说要去办一件重要的事情，尤金知道，他是要去柔道馆复仇。
东魅不仅仅是为自己，也为阳花。他回到家后看见阳花照着他说的，在房间里挂起了画，并把他的房间一直保存的很整洁。一想到这，东魅就感觉很窝心，他对日本的仇恨就更大。东魅冲进柔道馆，将里面变成了屠宰场。逃出来的日本人赶紧去风月楼报告，请求支援。
风月楼现在的老板换成了李德文，他一直以为东魅已经死了。听说他又杀回来后，他赶紧让手下向上报告，并且说自己已经受伤了。尤金这段时间也住在风月楼中，他在这里等着东魅回来。
宾馆的爆炸也刺激到了熙星，熙星本来在街上拍着日本人的暴行，不过被日本人发现了。熙星让小裁缝带着照相机赶紧回家，他冲到宾馆查看情况。可是当他过去的时候，日本人正在清理残局。听到熙星一直在打听阳花的事情，日本人立刻将他抓到了警卫厅。警卫厅里的人都知道金家是亲日派，熙星没有被扣押，他发了一顿脾气之后离开了。熙星猜到阳花的炸弹一定是当铺老板提供的，他赶紧让老板离开，自己照顾店铺。熙星还把小裁缝和她弟弟带回家照顾，并且告诉父母小裁缝就是他要娶的女人。金老爷对于这件事情很是反对，不过金夫人对小裁缝的印象一直不错，她特地将小裁缝带下去好好照顾。
日本人借着这件事情大闹一番，伊藤博文下令将所有反抗的人都抓回来，可这样的行动只能增加朝鲜人的愤怒。在医院工作的小护士看不下去日本人的暴行，带着纱布和药品离开了。裁缝店里的小裁缝也因为救阳花而被老板赶走，在加上店铺老板，所有要反抗日本人的人都集中在了义兵的山头上。
为了防止他们滥杀无辜，阳花在之前已经拜托秀美将自己的信带给太上皇，让太上皇将所有的罪责都算到自己头上。因为自己有日本人的身份，这样才能堵住日本人的嘴。看到阳花的信，伊藤博文也没了借口。
伊藤博文虽然放过了朝鲜的民众，但却不会放过义兵，尤其是当李德文提供给他一份义兵的名单后，伊藤博文的手下也找到了义兵的据点。李德文虽然在日本人面前立了大功，但是也被义兵下了击杀令，负责杀他的就是爱信。为了掩护义兵们的转移和爱信的刺杀活动，房大伯和咸大婶跟往常一样带着下人抬着爱信的轿子在街上走。日本兵一发现轿子就开始射击，四个轿夫、房大伯和咸大婶都命丧当场。临死之前，房大伯和咸大婶正要牵手，可还没够到对方，日本人的枪就响了。
为了保护国家，很多义兵们都付出了生命。像是房大伯和咸大婶，最后一次追求幸福的机会都没有了。
爱信计划刺杀李德文成功，但没想到当她从屋顶上下来后，竟然看见房大伯和咸大婶倒在地上。爱信一直把他们当成自己的亲人，她控制不住自己，抱着咸大婶大声哭起来。这时候学堂里的老师和学生们都走了出来，可他们没有想到日本兵会杀个回马枪。为了保护爱信的安全，所有的学生和老师手挽手形成了一堵人墙。他们不惧日本人的威胁，就是不让开。日本人拿他们没办法，毕竟里面还有美国人，于是下令撤退。尤金和东魅也在这人群中，尤金终于发现，原来朝鲜人民保护国家的心一直没有变，即使知道会失败，但也不会有一个逃兵。
尤金回国后也过来见熙星，并拿回了皇帝送给他的国旗。两人去喝酒的时候也碰到了东魅，这三人以前是情敌，现在成了并肩作战的队友。但是东魅知道自己时日不多了，上次血洗柔道馆的事情，只要十天左右，日本人就会找上他。而且东魅的伤一直没有好，新伤加旧伤，让他走在街上的时候突然吐血倒地，还是尤金将他拖回来的。但他今天不能死，因为今天是十五，是爱信过来还钱的日子。东魅一直坐在店里等她，爱信也如约而至。
东魅复仇的第十一天，日本浪人终于再次来到日本，东魅就站在济物浦港口等他们。让东魅心痛的是，日本人竟然将他心腹的尸体也带了过来，东魅非常愤怒，举起双刀冲向人群。可东魅的身体并不像以前那样健康，再加上对方人多，东魅最终倒在了他们的刀下，这次东魅是真的牺牲了。这些日本人就将东魅的尸体拖在马的后面，大摇大摆地走进朝鲜。
熙星也在用自己的方式对抗日本人，他办的新闻社一直在向朝鲜人传递日本人的残忍暴行。报纸的内容惹怒了伊藤博文，他下令严查。虽然报纸上没有署名，但邮局的负责人在查资料的时候偶然间发现这些报纸是熙星出版的，他立刻告诉了日本人。熙星也预料到自己会被抓，于是将他拍的照片和一些资料都埋在了地下，自己在当铺中等待警卫厅的到来。这次，亲日派的名头没能保住熙星。在监牢里，日本人对熙星一阵暴打，但是熙星并不屈服。日本人非常愤怒，下一棍子直接打到了熙星的头部，就这样，熙星也牺牲在了日本人的监牢里。
义兵们也在为保护自己而计划着，黄恩师将义兵们分为了三个小队，他又拜托尤金帮他买了12张火车票，黄恩师打算让爱信带着女人和小孩先走。尤金也把皇帝的国旗送给了他们，一个小孩不小心在上面安上了手印，于是所有人也跟着一起在国旗上按手印，以此来表达自己誓死捍卫国家的心。为了掩护他们上火车，尤金让俊赫去偷了几件日本军装回来。第二天在火车站，俊赫他们混入站岗的队伍中假装检查，爱信他们顺利上车。但是这时候义兵们在山上却遭到了伏击。
日本人将抓获的义兵围在中间枪决，其他义兵为了救伙伴与日本人展开战斗。虽然他们武器简陋，但是配合默契，几轮枪战，日本人就全军覆没。可义兵们却不知道，刚刚的一切不过是诱饵，就在他们准备离开的时候，更多的日本兵围了过来，他们全部牺牲在了山上。
山上的战斗也影响到了火车站，日本人知道有一些义兵混进了火车上，于是他们打算严查。爱信见状不妙，立刻跟俊赫他们商议要提前开火车。可是这时候尤金还没有上车，再加上外面的守卫很严格，尤金带着枪没办法进去。不过幸运的是，日本的一个贵族男爵过来要坐火车，尤金立刻上前跟他说起森刚志，男爵还以为尤金是森刚志的好友，便与他一起同行。就这样，尤金躲过了日本的搜查，但是这时候火车已经开动。尤金一着急，拽着男爵就往前跑，终于在最后一刻跳上了火车，男爵还为此对尤金表示感谢。
在火车上，尤金很快找到俊赫和爱信，而火车里的日本兵也在拿着画像寻找爱信。到了爱信的车厢中，日本人拆穿了俊赫，爱信立刻拿出枪反抗。可日本人越来越多，在最紧急的关头，尤金将男爵作为人质带了过来。日本人担心男爵的安危，不敢轻易开枪。尤金就这样一点点将日本兵逼退到另一节车厢上。
尤金的枪没有打向日本人，因为他只有一颗子弹了。当火车经过山洞时，尤金将所有日本兵逼退到下一节车厢中，自己回身用最后一颗子弹打向了火车的连接处。爱信安全了，可是尤金自己再也没有了逃走的机会，他面对着爱信，背后日本人不停地开枪。在爱信疯狂地哭喊中，尤金葬身在火车里。
尤金、东魅、熙星因为爱信相识，虽然身份不同，但最后也是因为爱信，他们都成为了守护朝鲜的烈士。而爱信也并没有因为尤金的牺牲而消沉，她带领着剩下的义兵在满洲里训练，就像是当初张猎户训练她一样，他们在时刻为拯救祖国而准备着！最后，当铺老板也回到了店里，他们将白瓷、怀表、武士刀、药铺柜子都供奉了起来，分别代表黄恩师、熙星、东魅和尤金。几年之后，曾经为尤金工作的小男孩也已经长大，他也成为了拯救国家的战士。
朝鲜与日本、美国相比虽然很弱小，但是他们拯救国家的心却一直很强大。他们坚信自己一定会成功，因为日本侵略不会拼命，而自己保卫国家是拼了性命的，所以朝鲜一定会战胜侵略者。