朱蒂向小兰和园子坦白了自己FBI的身份，而朱蒂还向小哀提议加入证人保护计划。另一方面从学校回来的路上步美与柯南他们分手后径自往家走。
突然她和一个穿雨衣的男人撞在一起并仓皇离去，而这个人却是杀人嫌疑犯！在警方的调查中步美说出手上发现了一个类似"5"似的记号，而这个记
号究竟又是什么意思呢？
步美偶然撞上的杀人魔在逃。根据在她手上留下的痕迹，柯南和佐藤警官确定了犯人所乘车辆的车种，之后紧急拘捕了3名嫌疑者。因为犯人可能持
有沾血的钥匙，柯南推测钥匙孔里会有血便请求测试荧光反应，但是竟然都没有检测出反应！就在这时柯南发现了犯人躲避检测的发法，在柯南的协
助下警方终于逮捕了犯人。
小五郎带着小兰和少年侦探团的孩子们来到被称为地球遗产的人造木屋的集落·鬼泽乡去观光。这个村庄里最近流传着小孩幽灵的传言。而到了夜里
，柯南他们为了确认幽灵而出去散步的时候，步美却和少女幽灵相遇了晕了过去！而对于步美的发现村子里的人却极力否认，到底是幽灵少女还是真
有其人？