元太带朋友们来到一家宠物店，没想到居然发现了老板白井的尸体，奇怪的是在他的店里居然出现了本不该在这个季节出现的甲虫，为了进一步进行

调查，他们从宠物店里拿了一张群马县甲虫博物馆的宣传单，与偶遇的高木一起驱车赶往群马，在这里他们认识了博物馆职员荒木、甲虫研究家榛名

和杂志社编辑石田，当得知白井被杀的消息后，每个人都连忙推卸，但根据目前掌握的线索，凶手一定就在他们三人之中。

帝丹高中最近发生了不可思议的灵异事件，小兰本想拜托小五郎调查却被拒绝，所以由柯南出马破解校园灵异事件之谜。期间，小兰他们还遇到新出

医生，于是一行人在园子的带领下首先来到了体育馆，这里曾莫名的出现了两年前就已死去的保坂的书桌，接着又来到了诡异的图书馆和导致保坂死

去的楼梯，经过一圈查看，柯南已大致明白，就在这时，操场中间突然出现了保坂的书桌……

大家找到校长询问他下雨的时候是否出现在操场，没想到却得到了否定的回答，为了证实校长的说法，柯南又来找了在保健室休息的世古国繁，因为

他与保坂从小一起长大，所以又了解了更多关于保坂的事情，这时，小兰在走廊的木板上发现污渍，柯南将这些污渍与操场上出现的刮痕相联系，没

错，制造灵异事件的就是那个人!