正在进行的推理游戏却变成了真正的杀人事件，在列车到达名古屋前柯南他们要在乘客中揪出真正的凶手来，在他们四处寻找线索的时候灰原却忍受着内心的煎熬。内心忐忑不安的灰原正在受到组织的威胁，组织的黑影已经更近一步接近灰原，她绝对不能以这种摸样被人杀害。

围绕着由推理游戏急转成的杀人事件，柯南在询问过车内有嫌疑的人后渐渐有了线索，事件背后的凶手终于露出了马脚，正在他上演推理秀时却有其他的事情发生。单独出去的小哀至今未归，而世良真纯也被神秘人物电晕带走，但这个车上还藏着不一般的人物，最后谁是赢家现在还没有定论。

八号车厢里的杀人事件已经侦破，而有希子与苦艾酒的对峙还没有结束，在八号车厢制造火灾假象后等待着小哀的是波本。与苦艾酒所计划的一样，随着列车的爆炸苦艾酒的任务也告一段落，正在品味胜利成果的她却又看到了和少年侦探团一起的小哀，这一切的背后还有所隐藏，前来协助柯南的究竟是何方神圣？