揭开暑假序幕的星期天，阿笠博士陪着少年侦探团看完电影后往家赶，在电车上他们看到远方的楼顶上发生了命案，但到达现场后目击坠落的时间却是他们看到案情发生后的10分钟。五层的建筑不可能坠落这么长时间，为了找出案情的真相柯南立即对案发的大楼展开了调查。

毛利一家和柯南想要去的餐馆正在施工，很多以前的建筑都被重建或者改造，正当毛利感叹的时候工地里传来了很大的声音。建筑器材的散落发生了命案，被压在钢管底下的是朱古先生，而捆绑钢材的带子上有被割过的痕迹。最有可能作案的便是在场的三人，而这三个人都有作案动机，在检查了命案现场后柯南有了线索。

以大阪发生的事件为契机，平次等人特地来到东京搜查，事件现场是一所公寓的房间，经过柯南和平次的调查后判定这是一起自杀案件，利落解决案件的柯南等人准备乘坐电梯回去时又发生了命案。乍看之下发生在眼前的是自杀案件，但柯南和平次发现了很多疑点，根据高木警官打听的结果，柯南等人锁定了三名嫌疑人。