从火灾现场逃出来的柯南等人看到的是跪坐在地上的初穗，想要杀害馆长的三人却反被杀害，而初穗承认自己失手将想要对馆长下手的姐姐杀死，看到现场遗留的物品后柯南有了线索，这并不是一起单纯的正当防卫，在这个事件的背后还隐藏着不为人知的真相，隐藏在能面背后的真正凶手到底是谁？

在静冈县写小说的推理作家海棠千贺小姐招待毛利小五郎来她住的别墅，希望小五郎分享关于名侦探的办案经验，没想到见面后却没有要听小五郎分享的意思，而是一直在说自家人内部的矛盾。次日早上醒来的柯南等人发现海棠一家还没起床，再到卧室后才发现海棠夫妇以及海棠小姐的徒弟幸子小姐全部都被毒杀。

备受期待的黑色玫瑰演唱会即将开始，因为门票而卷入麻烦的园子又遇到了错怪她的古奈遥小姐，而古奈遥被偷走的门票竟然以事发咖啡厅的名义高价拍卖。还没有出勤的雅子自然成为了被怀疑的对象，但当他们前去询问时才发现雅子小姐已被人杀害，看似是偷窃杀人的现场却让柯南感觉到了强烈的违和感。