柯南在灵车中发现了遗失的遗嘱，小兰和少年侦探团赶到会场后才发现葬礼已经结束，而灵车正开往火葬场。情况十万火急，小兰等人在尸体火化前赶到了火葬场，而棺材内却并没有找到柯南，在大家束手无策时又传来了柯南的讯息。灵车有两辆，而载着柯南的老旧灵车正驶向报废场，在不知道灵车内有人的情况下柯南的处境十分危险。

千叶警官在警局四处询问有关“不明飞行物”的线索，却毫无所获，这天他回到家，收到了声称是自己宇宙第一大粉丝的人寄来的神秘邮件。在另一边，名为和田阳奈的女高中生来到毛利事务所，委托小五郎调查杯户公园“UFO”一事。杯户公园隔壁的杯户高中发生杀人案件，这两者是否有联系？

混凝土杀人事件还未解决网上就已经闹得沸沸扬扬，说是案件真凶是外星人而警察在故意隐瞒外星人的存在，将案件告诉过毛利小五郎的千叶警官为此被训斥了一番。柯南可以确定的是这起案件是人为的杀人事件，在走访犯罪嫌疑人朽木后柯南有了线索，到底朽木是用什么方法杀了被害人呢？