百里大沙锅，黄沙漫天。
巴东来花了五块大洋乘坐的马车也遭到时光一行马匪的拦截。搜身之时，巴东来大呼老脸丢尽。时光手摸出一堆银元的触感却未表现出来，巴东来却不识眼色絮絮叨叨地让他弃暗投明去打一棵树。插科打诨半天时光终于失去耐心，巴东来哆哆嗦嗦地坐上马车落荒而逃。他责令门栓要把每一个他放过的重度怀疑对象调查清楚，要对每一个人哪怕是身边人保持警惕性。他与屠先生是同一个想法，要把真种子找出来然后将其掐死，不能让共党的梦生根发芽。
巴东来与芦焱因积怨大打出手，诸葛骡子受托赎回被绑架的古老板，本是上海名媛的护士卞融返回上海。门栓将这些疑点人物的情况打探得一清二楚，似乎每个人都有顺理成章的出关理由。时光反倒对这些人更生警惕。门栓说将护送卞融回家的人全换成了自己人，时光不愿滥杀便先放过了她。
双车听从陈植的建议邀请船家的三个人喝酒讲和，船家却暗渡陈仓地连拔天目山三个站点，双车自己也差点被暗杀，讲和宣告破裂。双车念旧情时常去牢中探望陈植，告诉他如果屠先生怪罪陈植得跟他走。
时光留下的水袋子里最后一滴水被喝干，饥渴难耐的芦焱眼看要葬身在这茫茫大沙中。夜里他戴着路上捡来的牛头把高泊飞一行人吓得不轻，继而因体力不支昏倒在地。高泊飞搜出他身上标着天字号的水袋，色厉内荏的他将芦焱误当成时光的人而不敢杀，强说这人定是时光的阴谋，于是一伙人阴错阳差地将芦焱带到了两棵树。芦焱晕倒在欠记门口，被欠记的小老板救起。而在此之前巴东来也来到了两棵树，他耀武扬威地敲开西北大饭店的门却被一声枪响吓得屁滚尿流，只好下榻欠记。两大冤家随时将聚首。
双车误会屠先生意图正准备带着弟兄们放弃上海这块地盘退守，屠先生却发来急电搁置抗日计划，腾出全部力量对付共党和若水势力。时光也接到屠先生电报，蠢蠢欲动地准备将高泊飞势力清出大西北。
芦焱被高泊飞用骡子留在他身上的绳子绑住，正苦于自己难以解开。这时进来一堆便民装扮的日本人，似乎与黄沙会关系匪浅。他们正谈论着高泊飞的不靠谱，发现角落里的芦焱，正准备搜身。巴东来进屋意外给芦焱解了困。日本人出去后，巴东来似是无意将一把小刀放在桌上，口中仍旧是神神叨叨。然而当芦焱叫唤巴督教时，巴东来拿出被骡子抢去的宝贝并说“在呢，在呢，再吃就打死你”，芦焱想起当初将种子交给他的人曾经也说过同样的话。他意识到巴东来便是种子的头儿青山，用巴东来留下的小刀解开身上的绳子，激动得差点落泪。
因打碎了碗弄坏了墙，欠记的小老板来找芦焱赔钱。芦焱没钱正准备走，小老板却赖在地上哭诉起自己一贫如洗。他说两棵树就三样不要钱：西风、吃沙子和吃枪子，而自己的店原本叫西北大饭店，被黄沙会的高老爷威逼利诱送了牌子改名欠记，意为欠揍。芦焱同情他，把藏在脚趾间母亲留给他纪念戒指送给了他。小老板却说这价钱只值他睡到明天下午。
青山明面上为了邀功以换取通行证，向军部连长黄大伟举报芦焱就是畏罪潜逃三年的罪犯霍四古。芦焱被抓后，黄大伟却被芦焱唬得一愣一愣的，黄大伟让手下赶紧送走芦焱这个烫手山芋，却没想到卡车的轮胎被扎破。青山暗地里想将他与芦焱双双送出两棵树的计划落空。后又因来报霍四古两年前便已伏法，黄大伟便将芦焱放了。芦焱糊里糊涂地活了四年又被如此对待心里满是怨气，怒气冲冲地找青山讨要个说法。青山解释了自己的意图，并指出屠系出了个心狠老辣的后背人才，让他们现在进退维谷。
时光带着重伤濒死的骡子来找高泊飞赎回古老板，高泊飞打着哈哈说与时光一笔勾销之前的矛盾。然而心思缜密的时光早已发现所谓的绑架赎人只不过种子们演的一出连环计。骡子、古老板还有第三个人便是想逃出两棵树的共党种子。而青山对此见死不救，芦焱气愤难当。
时光来了，大风暴来了，送死的人也来了。
黄沙会打一棵树之时，为了掩护真种子，钱串子绑架古老板，诸葛骡子送赎金，自以为天衣无缝的巧妙连环计，却被聪明绝顶的时光识破。时光准备把三人带走，高泊飞却以钱串子是他心腹而另两个是他财神而不肯放人。外强中干的高泊飞心底也惧怕时光，时光软硬兼施，最后将人留给了高泊飞。毕竟他最大的目标不是灭了那几个种子，而是端掉黄沙会。青山说时光就是一个计划的天才，屠先生后继有人了，并让芦焱留下拖住他们掩护他逃命。
门栓朝大沙锅打了个信号枪，又带着人来到西北大饭店跟前，高泊飞以为他们是来挑衅自己的。黄沙会的人正犹豫着要不要开枪，却没想到门栓带着人又转了个向进了对面的欠记打算吃饭。于是黄沙会隔街笑骂天目山的人是一帮怂货诈唬他们黄沙会。明为吃饭的门栓命人包围了欠记，此时青山和芦焱还在店中。青山仍是装成迂腐老先生的模样，门栓说不会杀他让他俩去烧饭。
高泊飞两个手下猫在欠记门外查探情况被门栓威胁着爬回西北大饭店。高泊飞脸上无光，趁着时光不在大胆挑衅，说时光是屠先生的野种劝门栓弃暗投明归顺若水先生。门栓让手下记下账故意大声告知高泊飞他要发电上奏高泊飞信口雌黄诽谤军部机要人物，请求上峰处置高泊飞。高泊飞怒火中烧，直接开着机关枪扫射欠记，欠记外墙被扫成了个窟窿。门栓眼看鱼已上钩，大笑一声记账高泊飞不知悔改，命令手下开枪回击，只许打伤不能打死以好向上头交代。门栓枪法了得，一打一个准，高泊飞被打伤带着人缩回屋中。
骡子三人被绑在地下室严刑拷打，高泊飞说只要交代谁是真种子就饶他们不死。然而三人宁死不屈，骡子率先死去，钱串子嘲笑高泊飞不敢朝活人开枪。本就憋了一肚子气的高泊飞二话不说朝钱串子开了一枪。钱串子满身是血，临死前冷嘲热讽地说高泊飞只有打中国人才特有种。
高泊飞命令手下们陆陆续续地准备将家底都搬出西北大饭店，还带着至死不放弃的牌桌。门栓笑他不成气候，下令开打，黄沙会随之反击，两方正式交战。身配重武器的黄沙会在与兵器粗糙的天目山对战中却是屡屡占下风。门栓命人发射信号弹叫回了正在大沙锅的时光。高泊飞放话谁能打死时光便赏他黄沙会的二当家。时光骁勇善战，没人能伤他分毫。最终，高泊飞死在时光的枪下。他临死前说着自己不明白不明白，死不瞑目。时光让弟兄找个地方把他卖了，墓志铭就写我明白了。
时光曾说过他再次下马之时两棵树便是他的，而现在两棵树确实是他时光的占地了。他打算在两棵树建立起秩序。
目睹了一晚上的厮杀枪打，青山看出巴东来和何思齐的身份瞒得过天目山几万双眼睛，却没法在精明的时光眼底下脱生，只好连夜逃命。他让芦焱帮自己尽命拖住时光。芦焱直言不喜欢青山，憎恨他不把人命当回事。