1946年的秋天注定是个多事之秋，保密局总部迁回南京，留在重庆的特务越发猖狂。延保密局向延安输送了大批的特务，陈玉婷悄悄把这个消息告诉了赵云飞，。为了肃清在延安的特务，组织通过对李金平的考验派她跟随琳达清理特务。这些潜伏在延安的特务，已经被延安盯上了。琳达回到了延安和李金平见面，李金平在延安工作发现了许多的特务。
马五的妻子和小舅子四处找曹顺和庄媚娇送礼疏通关系，不过曹顺并没有收，而是叫他拿下去给兄弟们分了。庄媚娇更是软硬不吃，姐弟俩为了抚恤金的问题着急不已。赵云飞和陈玉婷坐在河边聊天，有些东西，赵云飞看见了就忘不掉，他和陈玉婷讲了小时候的故事。现在战争已经消失了，赵云飞不理解自己继续做情报工作的意义。
延安。琳达和李金平正在全力搜捕特务，几人经验丰富效率很高。吴嫂又去杂货店买东西，说是家里来了客人，陈炎和赵云飞去府里喝酒了。吴嫂一直在被庄媚娇跟踪，便利店也一直处于被监视状态，庄媚娇实施了分区停电缩小范围，王震川和谢小雅察觉他们已经被怀疑了。特务深更半夜闯入杂货店搜捕，弄得一片狼藉后才离开，王震川只能下令把其他情报通过另外渠道发出去。琳达和李金平迅速锁定了特务，曹顺对庄媚娇没日没夜让兄弟们巡逻一事很不满，庄媚娇却直接叫他滚蛋，震惊了一办公室的人。
战乱时期，军属赖以生存的生活费和抚恤金被断掉，引发了他们的极大不满。马五妻子和小舅子更担心了，只能夹紧尾巴做人。陈玉婷现在为了抚恤金这件事忙的焦头烂额，除此之外还要忙着查清楚父亲陈怀恩去世的真相，赵云飞也想要帮忙。
延安方面暂时无法证明季敏和敌特有关系，但是依然没有放松警惕，李金平发现了一个熟悉的面孔，虽然不记得他是谁，但是确认他一定是军统的人。赵云飞再一次去了资料室，想要调查一些陈怀恩的资料，差点被发现。赵云飞查了李卓群的两份清单，并且记得清清楚楚，陈玉婷一直再找李卓群的孩子，他可能知道些什么。陈玉婷和赵云飞找到了李卓群的小老婆，可是她说自己什么都不知道，不然也不至于在李卓群死后一直做皮肉生意。
琳达和李金平抓捕特务，却漏掉了躲在人群里的漏网之鱼。潜伏在延安的特务十分谨慎，经常利用一个动作一个眼神来传递情报。
潜伏在延安的特务无所不在，利用一个眼神一个动作就能传递消息。深夜，李金平带人抓捕了崔教官，他是李金平的老师，李金平希望他弃暗投明。但是崔教官什么都不说，李克农表扬琳达抓住了一个关键特务，更是亲自去见了崔教官，劝他弃暗投明与我们合作。共产党地下小组要将一帮孩子运往上海，曹顺的任务是抓到这批孩子，对他们抓捕他们的父母很有帮助。孩子们都想走出这里站在蓝天下，沈洁答应他们一定要带他们离开。曹顺开始重点监视码头，沈洁他们已经接到了撤离通知。
沈洁收拾行李时简妮来与她告别，她真的很担心孩子们，简妮决定陪他们一起转移孩子们。但是沈洁不想把她牵扯进来，她应该平平安安的，可是对于简妮来说，她只是做了一个最正确的决定。曹顺他们发觉自己收到的是假消息已经来不及了，沈洁和简妮顺利把孩子们带上了船。但是，上海那边也是一道关卡。
家属们都求着陈玉婷帮他们说话，他们需要那些钱过日子。马五的小舅子告诉陈玉婷自己知道李卓群留下来的东西在哪里，陈玉婷拿出了一笔钱，得到了一些新的消息。陈玉婷打算自己去做剩下的事情，不让赵云飞继续继续插手了，赵云飞离开之前，陈玉婷依依不舍的抱了他。
崔教官希望李金平看在往日情谊放了自己，他是自己最心爱的学生，但是李金平更加希望他留下里，选择一条正确的路。烈士家属进行游行要求把抚恤金还回来，军统只能把家属会代表请过来。陈玉婷替他们去陈情，还提到了李卓群的家产问题，和陈怀恩的死颇有关系。陈玉婷无法忍受父亲不明不白的死因，只想要一个真相，可是他们依旧坚持是共产党害死了陈怀恩，外面的那些流言蜚语都不是真的。陈玉婷失落离去，一整天都闷闷不乐的。陈玉婷突然要和赵云飞到此为止，他们没有结果，赵云飞和自己绑在一起只是白白耽误时间，但是赵云飞想要陪着陈玉婷把真相查清楚，陈玉婷还是无情的甩开了他的手，她满心只有父亲。
局座劝陈玉婷放手，很多事情并没有想的那么简单，他让陈玉婷回去休息不要再管审读组的事情，这样对她也是一种保护。陈玉婷怒气冲冲地回到办公室，有时候真相让人无法接受。陈玉婷跑去买醉，她加入军统是为了像陈怀恩一样除恶扬是，可是为什么会变成现在这样。赵云飞把她送回了家，让她回去之后好好休息，陈玉婷想和他一起去一个没有人认识他们的地方重新开始，赵云飞答应了，可是陈玉婷知道根本没有这种地方。赵云飞一直在楼下，陈玉婷却没有勇气开窗。
次日，赵云飞带着吃的去陈玉婷家，但是陈玉婷一直不开门。延安，琳达和李金平分头行动抓捕了又一批特务，延安的清查活动很厉害，敌方怀疑他们之中有共党密探。
国民党内部也有许多倒向共产党的人，他们决定重点注意一下这些人，也许他们已经叛变了。李金平和琳达在延安的活动很成功。中原的剿匪计划到底是如何泄露出去的，程世儒认为也不一定是泄露，毛泽东的作战计划一向都是他们摸不透的，这场战争虽然兵力悬殊，但是结局如何也很难说。庄媚娇路过审读组特地去看热闹，没看到陈玉婷和赵云飞的人影很得意。陈玉婷很快就回来了，庄媚娇讽刺道审读组一直都是摆设，她回不回来也无所谓。大家都收到了调令，明天就要走了，他们毕竟要为自己的未来考虑，以前好歹有陈玉婷和上面通气充门面，可是现在什么都没了。
大家都收拾东西离开了，陈玉婷强撑着独自流泪，赵云飞在办公室门口看到这幅情景也很失落。办公室突然传出一声响动，陈玉婷摔碎了照片，摔碎了桌上所有的东西。赵云飞可以留下来陪陈玉婷，陈玉婷要他别演戏了，他们本来就不是情侣，赵云飞应该去做自己想做的事情。赵云飞看了一眼报纸说，也许他真的该做想做的事情了。
赵云飞去王震川店里照例买了一些巧克力和酒，让他用有志青年去延安的报纸包起来，王震川很是警惕地把他赶出去了。李金平看到季敏时又想起来石佩英，石佩英死的时候刚好是季敏当班，但是她也受伤了。可是李金平心有疑虑，他们怀疑季敏很长时间了，但是一直没有证据，而且季敏要和刘处长结婚了。琳达认为一切皆有可能，他们要多多关注她的行动。
赵云飞和陈玉婷一起喝酒，他第一次见到陈玉婷就是从酒开始，陈玉婷很难相处，命运却很奇怪地把他们绑在了一起，赵云飞渐渐不再演戏假戏真做了，他很想牵着陈玉婷的手永远不放开。赵云飞向陈玉婷坦露了心迹，可是与此同时，赵云飞听从内心深处的召唤准备去往延安，他必须做出自己的选择。
刘处长去接季敏下班缺额被告知她已经下班了，有人看到她去了后山，季敏去看却没看到什么。回到家，季敏已经回来了，说是被老伯拉去给羊接生了。实际上，季敏就是潜伏在延安的国民党特务。赵云飞和陈玉婷去店里买了些东西，王震川躲起来没有出现。庄媚娇一直盯着杂货店，但是一直没找到什么可疑的人。赵云飞去教堂找沈洁，陈玉婷答应帮他打听。赵云飞想要调到前线，说要给他们争取一个光明的未来，陈玉婷牵起了赵云飞的手，赵云飞心中却很忐忑，他根本没办法去前线和一直敬佩的共产党打仗，至于陈玉婷为什么不说话，也许是看破不说破。
赵云飞带着陈玉婷去高大福家里吃饭，高太太本来帮他物色了一些结婚对象，见状连忙把照片收起来。大家都希望他们早点结婚，不过赵云飞的意思是要等他们离开保密局再说。吴嫂送他们离开，陈玉婷总觉得吴嫂有些不对劲。延安特务传来消息，程世儒亲自部署抓捕七叔。程世儒认为王震川没那么简单，并且叮嘱庄媚娇抓捕七叔的任务一定要保密，尤其不能让赵云飞和陈玉婷知道。程世儒带领曹顺去抓七叔，喧嚣的街上暗流涌动，程世儒和曹顺等不及了直接动手。