就在谢贵、张丙抢先发兵包围燕王府时，宋忠还在都督府等着张信的好消息，但他却等来了张信反水的坏消息。在与张信的格斗中，受伤的宋志用诈死之计骗过张信，杀了张信后，宋忠立即点起两营兵马来杀燕王。 谢贵和张丙的兵马把燕王府团团围住，为防内有埋伏不敢贸然杀入，张丙提出把朝廷要抓的燕王部下名单写在纸上用箭射进去，叫燕王按名单先把人抓了然后交给他们。 燕王将计就计，开门叫谢贵、张雨进府接收朝廷钦犯，等到宋忠赶到高喊谢贵张丙不要进去时，为时己晚，燕王府的大门关上了。 宋忠正在外面焦急地等待时，墙头上挂出了谢贵张雨的人头，燕王登高一呼。那些原是他手下的官兵无心交战，一触即溃，宋忠弹压不住，只好仓皇撤退。 燕王带着手下八百壮士乘胜追击，一举攻下北平九门，既而打出“奉天靖难，以清君侧”的旗号，杀向京都来了。 燕王朱棣起兵发难的消息传到京城，建文帝以为燕王的数百兵马对抗朝廷简直是以卵击石，十分轻敌，只发宋忠本部兵马围剿燕王。

妙云得知朱棣起兵的消息，十分焦急。但建文帝仍不把燕王放在心里，他对妙云说：朕与你相见，从此不提燕王，只与你谈论诗词。 燕王得知朝廷并没有派兵马前来征剿，趁机迅速扩张，分别攻下落州、遵化、永州等城，北平周边除了宋忠退守的怀来，尽入燕王之手，燕军声势大振。 宋忠在北平大败，建文帝还在毓秀宫与徐妙云谈诗论画，接到宋忠等溃败的消息，这才惊慌。决定发兵50万北上征剿，但遍视朝臣，竟无一人愿领兵挂帅。奉先殿上，建文帝跪在朱元璋的画像前，希望皇爷爷能为他指出一位能领军打仗的将领来，因为当年朱元璋把开国元勋皆赶尽杀绝，目前朝中己无良将可寻了。次日，黄子澄举荐曹国公李景隆为领军统帅。建文帝准奏，遂令李景隆为兵马大元帅，统率50万大军征剿朱律。 李景隆的兵马一到，龟缩在怀来的宋忠腰杆也硬起来了，他与李景隆的前锋陈亨会合，杀向北平，准备一鼓作气，收复北平。

宋忠的兵马原是朱棣的旧部，对阵中，朱棣略施离间之计，宋军尽皆倒戈，燕军杀了宋忠并活捉了陈亨。 燕王大败宋志后，又与李景隆展开激战，终于将李景隆的50万大军杀得弃盔丢甲，狼狈逃窜。 燕王朱棣乘胜率师南下，冒险绕过久攻不克的山东、河南，直抵长江北岸，遥指金陵。 燕军兵临城下，朝中大臣正在议论纷纷，忽然接到燕王要求立即除掉奸佞齐泰、黄子澄的檄文。建文帝在松了一口气的同时，又觉得左右为难，毕竟齐、黄两人是他的左臂右膀，但迫于压力，只得下令将齐、黄二人削去宫爵，逐出京城。 但燕王对建文帝作出的让步很不满意，他对前来谈判的李景隆说，皇上不诛杀齐、黄二贼，决不收兵。