第17回后半部－第23回前半部。

类型：贪污、纵火、谋杀

改编自：吴铭汉夫妇命案

海边发现了一具载浮载沉的男尸，身份证实是一名参与多个法案的市政府科长的尸体，接连科长夫人也在家神秘死亡，而夫妇两人的死亡意外扯出了现任市长“何嘉聪”的‘都市变更法案’，而在海边的旧房子也因为不肯搬离的钉子户而被人蓄意纵火烧毁。同时，何嘉聪身旁的两个女人：妻子“孙虹云”与情妇“叶晓雯”为了争取各自的利益而明争暗斗，也进而出现了牺牲者。杜亮勤面对前女友“高怡如”的归来而搞乱了思绪，也意外发现洪振时的侄女竟然也是高怡如的时候陷入左右为难的局面！石头面对亮勤的失常，而局里又出现了通风报信者！在这种情况下，石头将如何带领地检署闪电组，进而把市长何嘉聪的真面目撕开？

第23回后半部－第31回前半部。

类型：毒品、走私、卧底、爆炸

改编自：青少年渗入校园贩毒案

市政府弊案落幕，但林文贤的余党“张志强”却挟著报复心而绑架了怡如。但新进检察官“雷钧安”展现了高度的谈判技巧顺利将怡如救出，石头也积极将雷钧安争取进闪电组内，但法官“齐英武”却将张志强无罪释放！就在此时，卷土重来的毒品市场也悄悄伸进了校园之中，而国基的表妹“谢婉华”成为了牺牲者，国基在悲愤下为了查出真相而锁定了角头大哥“曾进海”并在其身旁卧底。而检警好不容易逮到曾进海犯罪证据，但齐英武却再次轻易把所有证据驳回，将曾进海无罪释放。闪电组为了拆穿齐英武的真面目，却发现了齐英武和曾进海属于同一个不法组织！石头要如何与亮勤、王菲与钧安去肃清所有的司法败类？

第31回后半部－第38回前半部。

类型：军火、谋杀、劫囚、刑求

改编自：拉法叶军购案

齐英武被捕入狱后竟然在监狱中自杀身亡，并且死因与雷钧安的父亲雷圣文相同，都是服用氰化钾胶囊而死，使得雷钧安更加重视自己父亲的命案。雪莉在一次偶然下发现了曾进海所说的军火和毒品的仓库，但仓库竟然只是一家普通的家具店！而雷钧安找上了自己多年的好友“唐定军”和自己父亲的老长官“王立威”，也慢慢的朝几名军方人员的身上调查。此时出现了牺牲者，死者是一名将军，但根据证人提供的绘图证据，杀人凶手竟然是杜亮勤！杜亮勤因为涉嫌杀害一名少将而遭到逮捕，却在运送时被组织囚禁，同时组织用刑求的方式去逼迫杜亮勤，甚至利用炸弹来威胁整个地检署！闪电组该如何瓦解邪恶组织，而把神秘的‘老板’绳之以法？