乔伊像个巨大的熔化器，所有他周围的金属都会很快熔化。他身体出现的异能，不但让路人恐惧，也让他自己感到莫名其妙，并且害怕。这时，一辆车停在他面前，黑色行动队出现了，这些人用枪对准了他，并让他举起手来。还没等乔伊有进一步的反应，他们手里的枪已经开始熔化，乔伊趁机逃走，躲在小巷里。但很快乔伊又被黑色行动队的人发现了，正惊惶失措，黑色行动队的人突然像被狂风吹跑了，原来是神盾特工队赶到了，他们及时救下他来，神盾特工队的黛西，就是斯凯，她现在改名叫黛西。她说服了乔伊跟他们走，并让他进了一间封闭房，这间房突然腾空而起，将他带到了神盾局的空中飞行器中。
随后，黛西向乔伊解释了发生在他身上的怪事，因为她也曾经历过同样的事，也拥有着异能。
菲尔在拍下黑色行动队幕后神秘女人后，也赶了回来。他跟黛西庆幸着总算救下了第一个异能者。因为前面五个都被黑色行动队劫走了。
芭比为乔伊安排了新房间，并且告诉他这儿的人不会伤害他，他也伤害不了这儿的人。
菲尔和同事们研究着那神秘女人的来历。
黛西和迈克来到乔伊的房间。黛西进一步向乔伊解释了出现在他身上的特异现象，因为他身上已拥有了部分外星人的基因并被泰瑞根激活，黛西说，欢迎加入我们异人族。
乔伊不敢置信地笑了起来。但当黛西说他不能再回到以前的生活中了，乔伊发怒了，迈克手里的金属板熔化烫了他的手，黛西只能出手先将乔伊击晕。
菲尔让芭比打电话叫菲兹回来。菲兹却不肯马上回来，他正在摩洛哥查线索。他失去了爱着的女人西蒙斯，所以想查清巨石的属性，听说那块石头被埋在了尤卡坦，石头旁的卷轴盒里有张羊皮纸，解释了这块石头的属性。但被约瑟夫的黑社会组织抢劫带走了，所以，他要找到他来交换，他被绑着见到了约瑟夫，不顾付出生命的代价，抢走了羊皮纸逃掉。
菲尔按芭比提供的线索找到了那神秘女人，不料她早有防备，并反过来抓捕了他。她说自己叫罗莎琳。罗莎琳去接电话了，菲尔才有机会逃脱。
黛西和迈克去找林肯帮忙。林肯也是异人族，但他不想回来。正争执时，突然出现了一个杀异人族的怪物，三人合力才将怪物击退。但林肯的正常生活也毁了，有同事看到了他的异能，打了报警电话。因为正常社会对异人族也是追剿的。他依旧不肯黛西迈克回去，独自狂奔而去。
菲兹回来了，他满怀希望地打开羊皮纸，却发现只用希伯来文写着一个词死亡。菲尔劝解他要跟过去道别，他嘴上答应了。但后来却独自打开了一直封闭着的巨石，冲着它绝望地大吼。
同事们发现菲兹闯进了巨石封闭室，急忙赶去，将他及时拉出来，又封闭了巨石。这时，菲兹发现自己手上有砂，这砂看起来很寻常，但却比地球上的早十亿年。神盾特工队的人一起猜测，这巨石应该就是个传送门，通往宇宙的另一星球，而西蒙斯应该是被带到了那里，她还有活着的希望。新的发现让特工队的同伴们迅速行动起来了。
亨特一直记着要抓回沃德的事，他打算潜入九头蛇，伺机复仇。正是因为沃德那一枪，为了保护自己，女友芭比被轰掉了半个肺，差点送了命。芭比也想去，但她还没有伤愈，亨特不想女友再冒生命危险卷入这件事。
亨特设法找到了梅，她也同样对沃德怀有仇恨。亨特请她为他弄个假身份，然后打入九头蛇内部。沃德正在设法夺取九头蛇的权力，他带人抓住了九头蛇前领袖的儿子沃纳，用各种方式逼迫他妥协。没想到沃纳并不像他想的那样孬种，始终不肯妥协。两人选择了合作，重建九头蛇组织，并使其发扬光大。
菲尔和队友们，请来了兰道夫教授加入。果然，兰道夫从羊皮纸上发现了端倪，带着他们，一起前往英国查探巨石情况。他们赶到了那所城堡，找到了那处刻字的所在，紧接着，暗藏的通道被他们发现了，他们顺着通道走了很久，借着手里的手电筒光线发现，他们像是来到了一所奇怪的地堡，最终，他们发现了深坑，大家猜到了这个深坑是用来放巨石的。
黛西也请了加纳博士帮忙，想让乔伊加入神盾局。加纳发现了黛西身上的领袖特质。她作为异人族，很想找更多的异人族，利用他们与众不同的能力，跟神盾局的人合作。
黛西和迈克也赶到了地堡，和菲尔他们会合。大家启动了地堡中的设备，深坑忽然有了反应，发出巨大的脉冲声，将黛西震晕了过去。其它人却都没什么感觉。而菲兹从中发现了办法，黛西用自己的超能力打开了传送门，菲兹跳了进去，在另一端找到了西曼斯，并成功地救回。
林肯施展异能，总算逃脱了黑色行动队的追捕。但黑色行动队所属的ATCU组织将他的照片和信息全国发布，称他是外星杀人犯。露西打电话给林肯，想帮助他。可林肯马上挂断电话，并摔碎手机，去掉了身上被神盾局埋下的联络跟踪器。
亨特和梅去找能帮他们联系到九头蛇组织的斯巴德，探听到了有用的信息。
西蒙斯重返之后，由于长期呆在了另一个星球，身体机能发生了一系列变化。为了帮她恢复，菲兹带她去实验室转转，结果当她看到曾用来做传送门的巨石，现在虽已经碎裂成一堆石头，还是产生了反应，她曾经最爱的实验室也让她感觉不适。大家知道她有很多事没有说出来，比如，她是如何独自在另一个星球活下来的。但大家尊重爱护她，决定等待，到她自己想说的时候再听。
林肯躲到了一个朋友家，但当朋友从电视上得知他就是那个外星杀人犯，于是打了热线电话。林肯逃跑时他因受到了惊吓而死，林肯感到十分内疚。林肯打电话给黛西，诉说了自己的心境。
菲尔约了罗莎琳见面，她就是政府的秘密组织ATCU的总负责人，她所领导的黑色行动队总是在异能人出现的时间赶到，并将他们带走。神盾局的人怀疑他们将这些异能人杀害并研究，美其名曰为了给国民以安全感。这次见面，菲尔想劝她同意神盾局将林肯带走，但罗莎琳还是拒绝了。菲尔还想请求她一件事，不要透露出黛西的信息，他知道罗莎琳手里有张医院的照片，如果她将之公布，黛西的安全也将受到威胁。
黛西和迈克赶到去营救林肯，黑色行动队的人也到了。黛西想说服他不要再陷入对朋友之死的内疚，跟着她走。她表达了一直以来对他的爱情，当黛西成功说服林肯，准备带他撤离时，迈克进来告诉她计划有变，菲尔让把林肯交给黑色行动队。林肯再次使用异能逃脱。当黑色行动队又准备对付黛西时，菲尔选择了以后跟他们一起合作做为条件，才保全了黛西。
菲兹带西蒙斯去吃他精心准备的浪漫晚餐。西蒙斯突然哭了，菲兹搂住她安慰着。她离开得太久，有很多事需要重新适应。
亨特和梅经过一轮轮血腥残酷的杀戮，亨特最后被带到了总部，他将被安排与沃德见面，这正是他们此行的目的。