如今陈潢、靳辅二人的荣宠之盛，满朝文武官员无人可比，全都仰仗他们治理黄河有度，近些年来没有出过差池。所以伊桑阿想要凭借这件事情扳倒靳辅，纯属是不自量力，就连索额图贵为百官之首又是皇亲国戚，平日里也都谨言慎行。
但是索额图坚信靳辅的盛宠并非长久，何况他整天面对着天灾人祸的烂摊子，迟早会惹火上身，劝说伊桑阿坐等良机。一番话说尽，伊桑阿茅塞顿开，出言恭维索额图足智多谋。
正当索额图传授自己增长见闻的经验，忽闻圣旨将至，兴致冲冲地出门迎接。原本以为是恩旨赏赐，怎知康熙居然责备索额图妄言失检，褫夺其保和殿大学士之职。等到传旨官员离开后，索额图才算是后知后觉，忍不住感慨皇帝计谋之深。
此时康熙陪同孝庄皇太后前往五台山为黄河沿岸百姓祈福，岂料途中遭遇暴雨导致人仰马翻，尽管康熙带着大家克服重重困难抵达五台山庙里，可他看着门外雷雨阵阵侵袭，面色凝重。
今年秋汛将至，康熙没有十足信心能够渡过难关，虽然高士奇相信靳辅和陈潢，同样也不敢贸然笃定。事实上，陈潢早已想好对策，那便是炸毁老坝，舍大保小，通知桃源县全体百姓迁居。
然而炸毁老坝意味着任由洪水淹没桃源县，于振甲身为桃源县人，自然是不肯同意。陈潢耐心解释王登选修建的大坝外强中空，难以抵挡洪水冲击，若是熬过今年汛期，待到明年开春就能起到关键作用，如果洪水冲毁减水坝，恐怕将要祸及三省百姓。
可偏偏于振甲就是犟驴脾气，完全不听劝告，逼得陈潢扬言要告知靳辅下达命令。于振甲完全无惧官威，还要带着百姓加固堤坝，反过来指责陈潢等人治河五年毫无起色，每逢汛期都要往桃源县泄洪，令他彻底无法忍受。
之后于振甲带领桃源县全体百姓跪在河督府门外请命，靳辅好言相劝无果，继而搬出王命旗牌。此物犹如圣令不可违抗，于振甲失魂落魄走到门口向大家告知结果，众人闻言哭得撕心裂肺，哀号声不绝于耳。
随着降雨量越来越多，各地水位逐步上升，接二连三遭遇洪灾。靳辅派人通知陈潢疏散百姓，准备往桃源县泄洪。但是于振甲没有选择离开，继而带着自愿留下的男丁守着河道，眼看快要天亮，由于迟迟没有泄洪的缘故，最终引来黄龙过境。
众人见状惊慌四散，陈潢怒急攻心昏倒在地，靳辅亦是如此。也正因于振甲的愚昧无知，彻底连累桃源县乃至周边三省百姓，洪水犹如猛兽吞噬数以万计生命，无论贫贱富贵皆不能逃此劫难，处处可见饿殍满道，食人骨肉，堪比人间炼狱。
朝堂之上，太监总管宣读受灾地区的情况，在场大臣乃至康熙听闻无不落泪。当晚明珠来找高士奇，感叹靳辅和陈潢治理水患失职，想必明日早朝会闹得血雨腥风，但是他和索额图为漕运争夺多年，绝不可在关键时刻功亏一篑，想尽办法保住他们二人。
所以明珠叮嘱高士奇要跟自己互相配合好，唯有保住靳辅、陈潢才能保住彼此的身家性命，更是保住皇帝。反观索额图连夜召集心腹大臣们，共同商议关于声讨靳辅的事宜，务必要找到合适人选取代他和陈潢。
黄河崩堤，殃及三省，也正因于振甲的缘故，造成众多百姓伤亡。可偏偏索额图避之不提罪魁祸首，非要在这件事上联名扳倒靳辅陈潢，唯有靳辅下台才能让出河道总督的肥差，继而通知众臣届时看眼色行事。
自从决堤之后，陈潢接连三日高烧不退，躺在床上浑浑噩噩，反复念叨着萧家渡。靳辅召集河道官员们，再三强调自己会承担此次责任，无论何人接任河道总督，务必要都继续开展工程。
当晚康熙看着天下长河沙盘图，思忖明日如何应付那些乱臣贼子，又该如何保住靳辅。反观靳辅探望完陈潢，回到家里安慰夫人，若是圣上降旨遣送他流放乌里雅苏台，至少他们夫妻还能和儿子团聚，果然瓜尔佳氏破涕而笑。
次日早朝暗流涌动，臣子们还未发言，高士奇和伊桑阿已是争执不休，索额图附议靳辅治理黄河失职，导致万千百姓流离失所，不杀不足以正朝威平民愤。正当明珠准备要开口回击，岂料众臣纷纷跪在地上，异口同声奏请康熙下令处斩。
康熙表示金科玉律不杀无罪之人，所谓靳辅之罪全是臆断之词，索额图闻言召来候补布政使崔维雅，由他亲自呈上状告靳辅的二十四条大罪。此人曾是河道总督，略懂河务，后来被弹劾受贿撤职，可见其人品劣迹斑斑，不值得信服。
未等崔维雅说完二十四条罪行，康熙先行宣布退朝，之后连夜批阅弹劾靳辅的奏章，为此心力交瘁。索额图又来向康熙建议治罪靳辅，明珠紧随其后，与他在康熙面前吵了起来，到最后高士奇出谋划策，建议委派钦差调查实情。
最终康熙任命伊桑阿前往河道勘验，随行之人里还有崔维雅和宋之明，崔维雅献给康熙一本治河方略，声称乃是自己多年心血著作而成。康熙懒得翻阅，命令崔维雅带着弹劾奏折和著作，合同靳辅陈潢二人商议，以济河工。
离开皇宫后，明珠斥责高士奇不该支持崔维雅随行，显然这些人此行目的必定会给河督府闹翻天。然而高士奇心里自有注意，倘若一味和索额图争口舌之快，毫无任何用处，既然崔维雅是索额图的心腹，他若是去河道勘验肯定不敢胡作非为。
于振甲继续坐在家里三省吾身，唯独这次黑白双子都没有落进碗里，全因他一念之差，利民又祸民。官差突然上门将他带走，奉命送至京师问罪，于振甲没有反抗，并且还向母亲道别。
桃源县老百姓拦住去路，险些和官差发生冲突，直到于振甲夺过火枪喝令百姓让道，这才彻底震慑住他们。于母匆忙赶来叮嘱儿子，希望他切记做人不忘初心，只要对得起自己就好。
伊桑阿来到河督府亮明钦差身份，亲自带人前往河道勘验，果断拒绝靳辅随行。陈潢躺在床上闷闷不乐，生气他不该妇人之仁，靳辅也承认自己在这件事情存在过错，如果当初阻止于振甲就不会落到现在的地步。
但是靳辅觉得崔维雅的奏折没有任何高明之处，提醒陈潢抓紧时间看看内容，保不齐待会就要有一场交锋。正如靳辅所料，崔维雅意欲当众刁难，而他立马召集所有河道官员，展开双方的治河理念。
虽然崔维雅当官多年，可是对于治水也是一知半解，书里的内容在外行看来比较高深，但凡懂得治水的官员都能挑出诸多问题。陈潢见招拆招，接连指出书里的严重错误，嘲讽他著书不够严谨，实乃欺君之罪。
崔维雅觉得面子挂不住，硬着头皮和陈潢理论，岂料陈潢有理有据，甚至还将他的二十四条大罪贬得体无完肤，惹得在场人哄然大笑。崔维雅恼羞成怒，情急之下口不择言，到最后就连伊桑阿都保不住他。
索额图的如意算盘落空，完全没有料到崔维雅居然是这等庸才，如今康熙看过会议记录，急招靳辅和陈潢进京，此时若不扳倒二人，恐怕之后为时已晚。伊桑阿觉得机会还能再等，当务之急应该拉拢些懂点河务的臣子，着重培养势力必然会让皇帝忌惮，索额图思来想去，答应让崔维雅去广西接任布政使。
伊桑阿依旧是添油加醋地汇报着河道勘查结果，建议将靳辅、陈潢以及下河道众官员从重治罪，罚没家产，赔修工程。康熙完全没有听进去，三言两语打发伊桑阿，并且在崔维雅的著作上标注失望二字，明珠见状偷笑。
待早朝结束，于振甲跪在门外请奏面圣，迟迟未得回应，居然直接闯入大殿。康熙倒也没有因此大发雷霆，而是斥责他自以为冒死护堤乃是英勇之举，实则是在乎自己的名声，根本不管百姓死活。
可惜于振甲固执己见，丝毫意识不到自己的过错，此刻索额图奏报瘟疫蔓延山东和安徽，朝野内外没有人愿意运送药品粮食。于振甲闻言毛遂自荐，并且在康熙和索额图交谈时，屡屡插话，康熙为之不满，喝令他滚出去。
于振甲离开时遗落鞋底子，光着脚走回住处，当晚索额图奉命来给他送长靴。然而等到次日，于振甲居然直接将靴子退还给康熙，表示自己身份不配拥有这么好的靴子，若是得此物必然会野心膨胀，妄想着升官加爵。
数日后，圣旨传至河督府，召靳辅入宫与合议赔修，选拔随行官员。靳辅知道陈潢心性，不愿让他牵连其中，但是陈潢质疑要跟他前往，尤其听闻圣意是让自己掏钱修建大坝，直言还不如在京城里坐牢。
如今京师城外全都是三省乞讨难民，康熙带着于振甲便装来此，无非是希望他能明白所为清官，并非是指清廉，更多还要断食清明公正。仅凭现在于振甲的所作所为，完全配不上清官，当他看着难民大娘的处境，忍不住难过落泪。
靳辅入宫面圣，看到站在旁边的于振甲，表示自己千错万错，最大的错便是没能砍下他的狗头。此话一出，于振甲大怒指责靳辅治河失职，二人针锋相对倒是冲散康熙想要叙旧的伤感情绪。
也正因于振甲还在执迷不悟，康熙宣布升任他为四品道合衔，御赐尚方宝剑，统领三省救灾事宜，遇到贪官污吏都可以先斩后奏。康熙此举明升暗降，实则借他之手惩治害群之马，顺便看清自己犯下的过错。
可对于靳辅，康熙始终信赖有加，甚至还质问他为何迟迟没有递来自辩的奏报，显然是不相信自己能够保他无恙。这次黄河决堤，康熙认为靳辅罪不至死，唯独是过于急进，显然忘记治河乃至长久大业。靳辅明白康熙的用心良苦，为之感动不已，君臣之间误会解开，冰释前嫌。
明珠和高士奇商议对策时，没想到康熙突然登门，吓得明珠赶忙躲进屏风后面。康熙注意到桌案上的茶杯，不动声色提及靳辅的处理结果，吩咐高士奇领衔呈上奏报，拟旨写明合适的理由，可以让靳辅、陈潢二人戴罪回去继续修补萧家渡。
等到康熙离开之后，高士奇来到屏风处，发现明珠坐在椅子上发愣，紧接长舒一口气，表示他们已经渡过这道坎，保住了头顶的乌纱帽。而在另一边，于振甲大张旗鼓地回到桃源县，在百姓们的簇拥下，回家拜见母亲。